181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4176 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  61.02 
 
 		 259 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  30.13 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  29.18 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  28.79 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  29.34 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  29.44 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  26.85 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  29.02 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  38.17 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  26.92 
 
 		 416 aa  78.6  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  32.71 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  28.22 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  28.22 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.4 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.4 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.4 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.4 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.4 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  26.4 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.89 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  25.24 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  26.09 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  25 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  32.77 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  22.12 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1246  methyltransferase  25.78 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  25 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 348 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  30.19 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.23 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.08 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  31.03 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.74 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  25.12 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  25 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  34.17 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  24.03 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.4 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  27.87 
 
 		 575 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  28.57 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  27.78 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  20.69 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  22.36 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  23 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  45 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.51 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  23.96 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.34 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.3 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  24.64 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.45 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  22.81 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.56 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.94 
 
 		 230 aa  46.2  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  29.63 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  23.68 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 201 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.41 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3211  Methyltransferase type 12  24.39 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.157903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  31.03 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  31.03 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  31.03 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 320 aa  45.4  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  37.65 
 
 		 559 aa  45.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.63 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  23.56 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1328  Methyltransferase type 12  29.86 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  21.65 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>