More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4137 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  79.19 
 
 
417 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
431 aa  859    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 
382 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
374 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
371 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  38.87 
 
 
395 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
400 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  35.63 
 
 
386 aa  206  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  38.28 
 
 
384 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  40.56 
 
 
366 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 
381 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  39.93 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
371 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
366 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  40.33 
 
 
380 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 
370 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  45.59 
 
 
370 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
434 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  38.63 
 
 
435 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
385 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
370 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
420 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 
380 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  39.67 
 
 
381 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  40.53 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
398 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 
380 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 
346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  39.71 
 
 
346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  38.51 
 
 
390 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 
376 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  40.75 
 
 
375 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  32.5 
 
 
375 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  32.14 
 
 
375 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
381 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 
377 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  36.86 
 
 
382 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  39.08 
 
 
351 aa  170  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
360 aa  170  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 
394 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  37.33 
 
 
375 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
1261 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
381 aa  168  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  41.49 
 
 
524 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  38.01 
 
 
382 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  40.55 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  41.61 
 
 
535 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  36.3 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
376 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
382 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
374 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
386 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.69 
 
 
361 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  35.69 
 
 
361 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.69 
 
 
401 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
378 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
423 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.69 
 
 
414 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.69 
 
 
414 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.69 
 
 
414 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.69 
 
 
414 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
369 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
372 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
378 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  34.56 
 
 
430 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
373 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  39.58 
 
 
394 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 
394 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 
376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.38 
 
 
364 aa  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
383 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
394 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
368 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
378 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  34.6 
 
 
373 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
361 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  33.85 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  38.33 
 
 
343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  33.85 
 
 
372 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
372 aa  146  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
371 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
376 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
361 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
340 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 
381 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
366 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
375 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>