176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4110 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  88.64 
 
 
221 aa  381  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  57.35 
 
 
215 aa  214  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  56.1 
 
 
214 aa  208  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  52.45 
 
 
210 aa  204  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  52.94 
 
 
210 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  46.8 
 
 
216 aa  198  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  49.27 
 
 
210 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.95 
 
 
209 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.76 
 
 
212 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.57 
 
 
211 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  49.03 
 
 
210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.81 
 
 
206 aa  178  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45 
 
 
210 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44 
 
 
210 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  43.63 
 
 
211 aa  168  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  43.5 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.74 
 
 
207 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44.71 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  44 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  44 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.65 
 
 
204 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.28 
 
 
212 aa  158  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  41 
 
 
208 aa  157  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.28 
 
 
213 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.23 
 
 
204 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.85 
 
 
218 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  53.14 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.79 
 
 
216 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.88 
 
 
215 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  50.27 
 
 
271 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.45 
 
 
213 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.11 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.13 
 
 
221 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.34 
 
 
210 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.33 
 
 
252 aa  136  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  46.43 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  41.87 
 
 
212 aa  134  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.44 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  48.88 
 
 
208 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.99 
 
 
210 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.9 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  40.32 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.45 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.8 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.79 
 
 
221 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.35 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.3 
 
 
194 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.3 
 
 
194 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.57 
 
 
199 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.86 
 
 
215 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.2 
 
 
215 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.3 
 
 
211 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  35.96 
 
 
598 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  40.66 
 
 
211 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  40.66 
 
 
211 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.24 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.84 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.89 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  36.17 
 
 
191 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.84 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.46 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.14 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.18 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.9 
 
 
219 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  36.9 
 
 
219 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  35.5 
 
 
589 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.65 
 
 
213 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  34.98 
 
 
192 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  36.9 
 
 
554 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  33.5 
 
 
612 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  36.36 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.83 
 
 
216 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  36.36 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  36.36 
 
 
219 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.43 
 
 
201 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.9 
 
 
213 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  38.46 
 
 
213 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1360  Dak phosphatase  42.46 
 
 
215 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  37.69 
 
 
212 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3125  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.74 
 
 
214 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.22 
 
 
213 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.36 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.47 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.72 
 
 
210 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  30.93 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  29.21 
 
 
582 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  29.85 
 
 
583 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  35.86 
 
 
588 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  30.69 
 
 
583 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  30.2 
 
 
583 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  30.2 
 
 
583 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  31.79 
 
 
567 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  30.2 
 
 
583 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  30.2 
 
 
583 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>