More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4092 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  80.57 
 
 		 251 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  53.01 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  53.36 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  43.4 
 
 		 621 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 861 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  35.18 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  35.37 
 
 		 413 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.12 
 
 		 820 aa  128  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  36.95 
 
 		 497 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  37.02 
 
 		 314 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  38.86 
 
 		 303 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  45.56 
 
 		 1392 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  39.19 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 		 1818 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  38.4 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  34.65 
 
 		 416 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  33.99 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  34.12 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  36.95 
 
 		 523 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  36.57 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  39.6 
 
 		 327 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  39.6 
 
 		 327 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  39.6 
 
 		 327 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.64 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.09 
 
 		 554 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  35.34 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  35.51 
 
 		 657 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.93 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  32.94 
 
 		 929 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.2 
 
 		 925 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  35.66 
 
 		 892 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  29.44 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  36.79 
 
 		 616 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  35.1 
 
 		 654 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  34.46 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  34.65 
 
 		 304 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  32.13 
 
 		 491 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1080 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  33.2 
 
 		 620 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 		 398 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  32.65 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  34.75 
 
 		 447 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  35.98 
 
 		 852 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  32.67 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  33.82 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  31.52 
 
 		 436 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  38.55 
 
 		 923 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  33.65 
 
 		 1007 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  32.28 
 
 		 358 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  33.2 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  34.75 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  36.15 
 
 		 781 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  34.05 
 
 		 444 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  36.4 
 
 		 570 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  32.09 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.57 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 617 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  39.66 
 
 		 960 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1911 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.57 
 
 		 439 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  34.63 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  38.41 
 
 		 1049 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 		 637 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  36.63 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  32.31 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 616 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  38.18 
 
 		 1186 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  32.97 
 
 		 433 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  34.01 
 
 		 535 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 611 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  36.03 
 
 		 444 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  34.77 
 
 		 437 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 		 842 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  33.58 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  38.75 
 
 		 965 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  28.72 
 
 		 826 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34.04 
 
 		 468 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  32.66 
 
 		 349 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  33.05 
 
 		 522 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  32.81 
 
 		 781 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.66 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  30.66 
 
 		 628 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  29.28 
 
 		 426 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  34.63 
 
 		 587 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 877 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  26.07 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 		 621 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  31.94 
 
 		 654 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  32.56 
 
 		 288 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  30.63 
 
 		 453 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.63 
 
 		 517 aa  99.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  26.9 
 
 		 586 aa  99.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  32.53 
 
 		 668 aa  98.6  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1492 aa  98.6  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  30.63 
 
 		 664 aa  98.6  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  33.77 
 
 		 446 aa  98.6  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31.2 
 
 		 751 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>