245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4088 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  78.97 
 
 		 232 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  47.62 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.72 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  34.68 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  36.7 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.59 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.32 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.8 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  32.31 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  31.22 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  33.82 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  39.2 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  32.59 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  32.66 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.05 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  31.05 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.05 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  32.43 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  33.63 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.96 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.66 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  32.87 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  29.41 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.57 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.96 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  32.87 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  33.01 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  29.74 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  41.35 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  31.9 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  31.51 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  31.51 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  31.51 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  31.51 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  31.51 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  31.51 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  31.51 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  31.28 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  43.64 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  30.09 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  34.35 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  30.77 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  29.74 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  31.17 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  31.11 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  29.49 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.61 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  36.55 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  32.43 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  29.82 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  29.03 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.1 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  28.88 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  39.55 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  38.52 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.76 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.94 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  38.32 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  39.55 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  29.02 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  31.55 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.18 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  36.03 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.54 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  28.37 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.03 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  35.88 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.78 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.03 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  29.73 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  29.73 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  30.88 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.45 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.17 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  29.73 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.7 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  31.22 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  38.35 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  34.09 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.82 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  32.05 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  36.54 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.41 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  28.93 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.83 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  35.58 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.41 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  29 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  33.1 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  26.49 
 
 		 817 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  32.81 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.14 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  26 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.36 
 
 		 828 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  29.8 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.17 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.97 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>