More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4082 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
284 aa  584  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  82.31 
 
 
278 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  64.71 
 
 
310 aa  338  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  62.55 
 
 
273 aa  332  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 
279 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  43.24 
 
 
278 aa  215  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  42.02 
 
 
277 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
299 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
405 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
265 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
246 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
275 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.21 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.2 
 
 
368 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.63 
 
 
266 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
270 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.77 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
267 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.8 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.67 
 
 
328 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.8 
 
 
372 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.05 
 
 
277 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.47 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 
368 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.44 
 
 
370 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
294 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.32 
 
 
370 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.97 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  28.32 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.32 
 
 
372 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  28.32 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.32 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
352 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.84 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.46 
 
 
370 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.36 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  25.84 
 
 
300 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  25.84 
 
 
300 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
273 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
270 aa  89  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  25.84 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  27.42 
 
 
571 aa  88.2  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
353 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  24.45 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
240 aa  87  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.42 
 
 
286 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27.48 
 
 
280 aa  87  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
262 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.6 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 
425 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  27.62 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.79 
 
 
562 aa  86.3  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
271 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
257 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 
300 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.51 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  24.08 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  26.92 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>