More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4019 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  97.87 
 
 		 141 aa  283  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 151 aa  227  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4922  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 142 aa  199  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 147 aa  199  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  65.96 
 
 		 145 aa  199  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  65.96 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  65.25 
 
 		 145 aa  192  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  65.96 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  66.43 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  66.43 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 144 aa  190  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 137 aa  190  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  61.87 
 
 		 144 aa  189  9e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  64.34 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 141 aa  187  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 139 aa  186  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  65 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 145 aa  184  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 139 aa  184  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 149 aa  183  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  60.99 
 
 		 144 aa  182  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  59.57 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  60.14 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  60.14 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 		 160 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 137 aa  177  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000439211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  57.64 
 
 		 160 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 		 144 aa  176  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 		 144 aa  176  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  59.12 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0988  50S ribosomal protein L16  61.48 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.702357  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3436  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109776  normal  0.197856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2833  50S ribosomal protein L16  60.74 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000261677  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0398  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0345  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.739822  decreased coverage  0.000284726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  60 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4906  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0575421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  59.7 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3769  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3061  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000117854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3739  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 138 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3788  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 138 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0821635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>