More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3995 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  100 
 
 		 132 aa  263  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  94.7 
 
 		 132 aa  250  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  71.97 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4944  ribosomal protein S9  62.12 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  61.11 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  61.11 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  61.9 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 130 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 130 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  59.85 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  60.16 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  58.33 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  61.42 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  57.14 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  52.67 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  54.2 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  57.14 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  56.39 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  52.34 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  53.33 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 264 aa  135  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  53.79 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  54.2 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  52.27 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 138 aa  133  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  59.09 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0506  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>