More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3992 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  74.77 
 
 		 219 aa  331  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  29.49 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  29.49 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  29.49 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.06 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.24 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.17 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.24 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  33.47 
 
 		 232 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.34 
 
 		 260 aa  94.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.59 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  29.34 
 
 		 247 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 		 254 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  33.05 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  28.75 
 
 		 300 aa  92.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  40.48 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  40.48 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.25 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  40.48 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  40.48 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  40.48 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  26.81 
 
 		 300 aa  92  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  32.91 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  40.48 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  39.61 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  29.05 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  30 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  27.39 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  40.52 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  40.52 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  40.52 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  40.52 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  40.52 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.52 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  40.52 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  40.52 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.12 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  39.66 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.73 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  37.61 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  39.13 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  39.13 
 
 		 245 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  27.6 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  33.59 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.84 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.86 
 
 		 229 aa  84.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  37.4 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  38.26 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  39.13 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  39.13 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  39.84 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  38.28 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  39.13 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.87 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  44.44 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  33.59 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.37 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  37.61 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  37.61 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  28.89 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.42 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  30.5 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.85 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  30.25 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.67 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  35.9 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  34.38 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  28 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  28.64 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  30.53 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.64 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  28.5 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  30.53 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  30.53 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.09 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  29.11 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.28 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  28 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  28.79 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  31.93 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  27.19 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  29.86 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  35.54 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.91 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.86 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>