21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3989 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3989  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1148  primosome, DnaD subunit  89.12 
 
 		 239 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000149796  decreased coverage  0.00111014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2341  primosome, DnaD subunit  62.08 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00367055  decreased coverage  0.00187348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0088  primosome, DnaD subunit  51.03 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0515  primosome, DnaD subunit  37.17 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0539  DnaD and phage-associated domain-containing protein  36 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245634  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_480  primosome component  35.11 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  29.81 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2981  hypothetical protein  32.84 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 632 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  28.26 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3331  DnaD domain-containing protein  31.34 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3088  DnaD domain-containing protein  31.34 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3267  DnaD domain protein  29.49 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  33.33 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3032  hypothetical protein  33.85 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  35 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  35 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  33.33 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  33.33 
 
 		 313 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  31.71 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>