295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3987 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1092 aa  2184    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  47.2 
 
 		 1090 aa  917    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  87.09 
 
 		 1091 aa  1865    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  55.08 
 
 		 1089 aa  1105    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.83 
 
 		 2240 aa  85.5  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 878 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.48 
 
 		 1737 aa  81.3  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.19 
 
 		 810 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 486 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1676 aa  79  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.96 
 
 		 626 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 974 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 		 3172 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 927 aa  69.3  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.41 
 
 		 988 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 615 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 620 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 673 aa  67  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 900 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.85 
 
 		 1056 aa  66.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 2262 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 893 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.08 
 
 		 784 aa  65.1  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 883 aa  64.7  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 		 639 aa  64.3  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.69 
 
 		 887 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1138 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.32 
 
 		 436 aa  62  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.33 
 
 		 620 aa  62  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.27 
 
 		 1056 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 637 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 643 aa  60.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.53 
 
 		 681 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 636 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 612 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  22.38 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 4079 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.9 
 
 		 784 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.13 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.86 
 
 		 3301 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.18 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 878 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  19.46 
 
 		 1154 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 847 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  20.82 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 566 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 718 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.08 
 
 		 1022 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 654 aa  57.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 		 1213 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.93 
 
 		 818 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 		 543 aa  56.2  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 465 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 602 aa  56.2  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 827 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 1049 aa  56.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.87 
 
 		 624 aa  55.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.31 
 
 		 733 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  19.42 
 
 		 750 aa  55.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 585 aa  55.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.5 
 
 		 292 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 		 638 aa  55.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  21 
 
 		 884 aa  55.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.43 
 
 		 643 aa  55.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1297 aa  55.1  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.89 
 
 		 1979 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 605 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 450 aa  54.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.22 
 
 		 503 aa  54.3  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 750 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 611 aa  54.3  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 301 aa  53.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 311 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 311 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.51 
 
 		 2145 aa  53.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.34 
 
 		 936 aa  53.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 579 aa  52.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.77 
 
 		 647 aa  53.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.89 
 
 		 572 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 599 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 423 aa  53.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  21.38 
 
 		 729 aa  53.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  22.58 
 
 		 267 aa  52.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 568 aa  52.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>