More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3935 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  57.53 
 
 		 643 aa  694    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  53.27 
 
 		 647 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  51.69 
 
 		 666 aa  659    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  55.03 
 
 		 655 aa  706    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  65.67 
 
 		 632 aa  888    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  52.2 
 
 		 652 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  50.62 
 
 		 649 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  69.55 
 
 		 653 aa  959    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  51.56 
 
 		 650 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  53.73 
 
 		 661 aa  655    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  54.05 
 
 		 656 aa  706    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  54.74 
 
 		 661 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  54.92 
 
 		 667 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 		 668 aa  641    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  55.94 
 
 		 649 aa  717    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  61.99 
 
 		 639 aa  819    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42750  acetyl-CoA synthetase  52.3 
 
 		 645 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.74253  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.23 
 
 		 658 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 		 645 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  52.29 
 
 		 646 aa  639    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  55.03 
 
 		 655 aa  706    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.54 
 
 		 657 aa  718    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.38 
 
 		 660 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.6 
 
 		 657 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  61.99 
 
 		 639 aa  826    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  49.54 
 
 		 651 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  52.13 
 
 		 629 aa  659    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  53.95 
 
 		 667 aa  694    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  52.85 
 
 		 673 aa  694    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.49 
 
 		 666 aa  709    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.08 
 
 		 657 aa  691    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  49.24 
 
 		 659 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.56 
 
 		 661 aa  694    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50.46 
 
 		 653 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  53.18 
 
 		 652 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50.61 
 
 		 660 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.78 
 
 		 656 aa  735    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  55.02 
 
 		 660 aa  710    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.68 
 
 		 660 aa  662    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  66.09 
 
 		 631 aa  889    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  55.31 
 
 		 661 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  51.37 
 
 		 658 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  53.17 
 
 		 629 aa  672    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50.46 
 
 		 658 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  51.99 
 
 		 629 aa  658    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53.16 
 
 		 658 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  51.15 
 
 		 657 aa  680    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  55.69 
 
 		 655 aa  725    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  52.8 
 
 		 663 aa  685    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  94.46 
 
 		 650 aa  1280    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.3 
 
 		 660 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  52.99 
 
 		 660 aa  695    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.61 
 
 		 649 aa  649    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  49.38 
 
 		 663 aa  648    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  51.44 
 
 		 665 aa  638    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  52.42 
 
 		 670 aa  647    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  51.01 
 
 		 649 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  53.66 
 
 		 635 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.7 
 
 		 656 aa  711    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.36 
 
 		 652 aa  711    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.6 
 
 		 655 aa  692    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  53.95 
 
 		 638 aa  659    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 667 aa  692    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  52.93 
 
 		 644 aa  651    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  50.49 
 
 		 652 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  74.13 
 
 		 644 aa  974    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.56 
 
 		 655 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  52.2 
 
 		 652 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  53.01 
 
 		 632 aa  652    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  55.47 
 
 		 657 aa  715    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  66.46 
 
 		 631 aa  891    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  52.2 
 
 		 652 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  55.64 
 
 		 664 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  51.57 
 
 		 632 aa  649    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  55.64 
 
 		 664 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 		 645 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  51.42 
 
 		 666 aa  650    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  51 
 
 		 659 aa  666    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  52.09 
 
 		 670 aa  693    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  54.7 
 
 		 660 aa  707    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  50.39 
 
 		 656 aa  654    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  65.52 
 
 		 632 aa  887    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  53.54 
 
 		 656 aa  674    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.28 
 
 		 644 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  54.38 
 
 		 654 aa  669    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  51.01 
 
 		 657 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 		 667 aa  713    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  55.43 
 
 		 638 aa  703    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  52.94 
 
 		 631 aa  642    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  50.73 
 
 		 636 aa  638    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 		 667 aa  676    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 		 666 aa  669    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  51.39 
 
 		 654 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  52.87 
 
 		 664 aa  711    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  51.07 
 
 		 680 aa  641    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.11 
 
 		 661 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 		 657 aa  716    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.9 
 
 		 658 aa  687    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  49.46 
 
 		 664 aa  657    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  55.28 
 
 		 649 aa  709    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>