16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3913 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  92.39 
 
 		 289 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  50.74 
 
 		 891 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  46.43 
 
 		 709 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  43.58 
 
 		 710 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  43.12 
 
 		 576 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  41.95 
 
 		 769 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  42.35 
 
 		 760 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  40.57 
 
 		 758 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  40.91 
 
 		 792 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  42.75 
 
 		 773 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  37.46 
 
 		 717 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  37.37 
 
 		 618 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  36.27 
 
 		 620 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  38.1 
 
 		 629 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 510 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>