More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3884 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
359 aa  724    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  83.84 
 
 
359 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  64.61 
 
 
357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  52.97 
 
 
679 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  52.97 
 
 
624 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  49.03 
 
 
374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  48.89 
 
 
377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  48.44 
 
 
616 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  33.46 
 
 
1219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
3301 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.07 
 
 
1644 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
856 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.07 
 
 
1644 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
1233 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
791 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  31.11 
 
 
1635 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
545 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
725 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
867 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  30.8 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
404 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
414 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
339 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
873 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  25.9 
 
 
383 aa  92  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  29.44 
 
 
759 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  29.54 
 
 
1232 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
1386 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
774 aa  86.3  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  31.44 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  30.12 
 
 
916 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  33.97 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
671 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  24.92 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  27.03 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 
995 aa  74.3  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
827 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
1044 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  26.16 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 
3145 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  29.14 
 
 
787 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
623 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
820 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.57 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
389 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  37.61 
 
 
542 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
743 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.19 
 
 
393 aa  62.8  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
390 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
375 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
408 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
370 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
408 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  38.57 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
408 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  25.53 
 
 
390 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
419 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
803 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  22.06 
 
 
400 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  27.27 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
362 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  29.1 
 
 
816 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
380 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
358 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>