More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3834 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 861 aa  1735    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  53.55 
 
 		 801 aa  816    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  48.15 
 
 		 952 aa  737    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  85.65 
 
 		 855 aa  1464    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  47.02 
 
 		 860 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  43.82 
 
 		 853 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  44.46 
 
 		 980 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 		 927 aa  505  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 		 908 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  41.34 
 
 		 1037 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 661 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  35.86 
 
 		 668 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.01 
 
 		 618 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 662 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.35 
 
 		 806 aa  346  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  38.53 
 
 		 775 aa  346  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  38.55 
 
 		 798 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  32.94 
 
 		 719 aa  344  4e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.81 
 
 		 905 aa  343  9e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  36.13 
 
 		 625 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  35.13 
 
 		 744 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 649 aa  340  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  37.17 
 
 		 762 aa  340  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  39.37 
 
 		 656 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  36.56 
 
 		 704 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  32.35 
 
 		 857 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  34.88 
 
 		 701 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  35.36 
 
 		 667 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  34.33 
 
 		 693 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  35.44 
 
 		 761 aa  334  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.76 
 
 		 643 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.76 
 
 		 643 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  32.44 
 
 		 829 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  35.62 
 
 		 681 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 683 aa  328  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 		 708 aa  327  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 		 774 aa  327  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 		 683 aa  326  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.72 
 
 		 646 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.67 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  34.84 
 
 		 751 aa  321  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  32.16 
 
 		 814 aa  320  7e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  35.07 
 
 		 683 aa  320  9e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  34.47 
 
 		 720 aa  320  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  35.7 
 
 		 683 aa  319  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  35.55 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  36 
 
 		 776 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  31.33 
 
 		 795 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.28 
 
 		 712 aa  318  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 683 aa  318  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.02 
 
 		 648 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 683 aa  317  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  34.6 
 
 		 683 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.75 
 
 		 640 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  34.6 
 
 		 683 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.21 
 
 		 626 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  33.19 
 
 		 683 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  38.5 
 
 		 656 aa  314  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  36.09 
 
 		 824 aa  314  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.21 
 
 		 654 aa  313  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 643 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.09 
 
 		 824 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  36.06 
 
 		 768 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.97 
 
 		 648 aa  310  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.57 
 
 		 734 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.42 
 
 		 811 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.3 
 
 		 712 aa  301  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  33.98 
 
 		 828 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.68 
 
 		 714 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  33.18 
 
 		 640 aa  300  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  34.98 
 
 		 742 aa  298  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  35.3 
 
 		 727 aa  298  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  31.15 
 
 		 770 aa  298  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.98 
 
 		 728 aa  298  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  35.37 
 
 		 727 aa  297  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  35.68 
 
 		 691 aa  296  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.03 
 
 		 728 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  35.7 
 
 		 714 aa  294  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 712 aa  295  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  35.78 
 
 		 651 aa  294  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 759 aa  294  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  36.17 
 
 		 677 aa  294  6e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.19 
 
 		 727 aa  293  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  35.12 
 
 		 755 aa  293  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  34.84 
 
 		 734 aa  293  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 		 707 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.25 
 
 		 833 aa  292  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  34.31 
 
 		 705 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.33 
 
 		 709 aa  291  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  30.62 
 
 		 880 aa  291  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 		 732 aa  291  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  33.91 
 
 		 709 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 709 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 		 709 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  33.07 
 
 		 680 aa  288  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  33.67 
 
 		 718 aa  288  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  34.96 
 
 		 739 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  30.36 
 
 		 642 aa  288  4e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>