More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3818 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  95.51 
 
 
334 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  100 
 
 
334 aa  671    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  81.42 
 
 
333 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  71.56 
 
 
329 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.63 
 
 
325 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.13 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  57.81 
 
 
324 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.59 
 
 
341 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.87 
 
 
325 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.09 
 
 
334 aa  348  8e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.47 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.13 
 
 
308 aa  325  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.26 
 
 
334 aa  325  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  53.14 
 
 
321 aa  324  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  52.17 
 
 
318 aa  322  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  50.97 
 
 
324 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.8 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
349 aa  318  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  48.69 
 
 
324 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
345 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  52.27 
 
 
338 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  51.48 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.87 
 
 
327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.48 
 
 
341 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  48.38 
 
 
356 aa  309  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  49.35 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.03 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.15 
 
 
341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.68 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.4 
 
 
356 aa  305  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.55 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  46.6 
 
 
317 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47.63 
 
 
328 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  46.13 
 
 
317 aa  299  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  49.01 
 
 
336 aa  295  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  47.7 
 
 
349 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
333 aa  289  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  46.53 
 
 
335 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  46.08 
 
 
335 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  46.22 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  46.73 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  46.98 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  45.12 
 
 
342 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  46.45 
 
 
337 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.2 
 
 
313 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  48.37 
 
 
333 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.98 
 
 
350 aa  279  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.34 
 
 
336 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  46.3 
 
 
328 aa  278  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  46.35 
 
 
346 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.02 
 
 
336 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 
336 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  47.39 
 
 
335 aa  276  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  45.32 
 
 
332 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  47.3 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.57 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.66 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.67 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.74 
 
 
350 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.33 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  47.33 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  45.59 
 
 
332 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  47.25 
 
 
340 aa  271  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  46.13 
 
 
332 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  48.97 
 
 
336 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  46.67 
 
 
334 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.05 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.89 
 
 
310 aa  269  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  45.37 
 
 
316 aa  270  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  47.57 
 
 
327 aa  268  8e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.59 
 
 
344 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.56 
 
 
341 aa  267  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  42.39 
 
 
315 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.3 
 
 
337 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  45.2 
 
 
333 aa  265  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  43.79 
 
 
325 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  44.41 
 
 
331 aa  264  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.11 
 
 
332 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  42.64 
 
 
337 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.93 
 
 
331 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.18 
 
 
354 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.81 
 
 
333 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 
350 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  46.41 
 
 
371 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  40.79 
 
 
340 aa  259  6e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  46.71 
 
 
334 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.57 
 
 
432 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  43.89 
 
 
335 aa  257  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  42.86 
 
 
330 aa  257  2e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  44.01 
 
 
332 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  42.86 
 
 
319 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  42.49 
 
 
337 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  45.57 
 
 
345 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  47.08 
 
 
362 aa  256  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  44.59 
 
 
370 aa  255  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  41.01 
 
 
330 aa  255  9e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  41.39 
 
 
335 aa  255  9e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  43.67 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>