42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3798 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 367 aa  745    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  64.71 
 
 		 368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  61.05 
 
 		 380 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  60 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  56.75 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  44.85 
 
 		 419 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  43.24 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  45.22 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  43.36 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  43.79 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  41.41 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  41.14 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  43.05 
 
 		 395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  44.96 
 
 		 398 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  44.96 
 
 		 398 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  43.26 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  36.21 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.65 
 
 		 831 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  31.46 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25.66 
 
 		 930 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.6 
 
 		 1079 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  23.5 
 
 		 652 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1163 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.57 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  26.26 
 
 		 1140 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  24.07 
 
 		 487 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  28.14 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1146 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.46 
 
 		 711 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1351 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  24 
 
 		 498 aa  50.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  26.38 
 
 		 639 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  29.3 
 
 		 472 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1030 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  24.14 
 
 		 623 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1750 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1177 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  23.08 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  25.27 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  29.3 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  28.26 
 
 		 686 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  24.1 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>