217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3789 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  92.39 
 
 
197 aa  359  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  80.2 
 
 
197 aa  326  1e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  83.76 
 
 
200 aa  323  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  61.75 
 
 
201 aa  221  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  50.82 
 
 
201 aa  187  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  47.06 
 
 
203 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  39.11 
 
 
188 aa  128  4e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  37.14 
 
 
187 aa  124  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.32173e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  37.14 
 
 
187 aa  124  8e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  46.79 
 
 
203 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  40.5 
 
 
207 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  45.75 
 
 
218 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  44.71 
 
 
203 aa  121  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  41.67 
 
 
203 aa  119  2e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  36.21 
 
 
184 aa  119  4e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  38.98 
 
 
185 aa  118  5e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  41.11 
 
 
203 aa  118  5e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  118  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  42.45 
 
 
182 aa  117  8e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  37.27 
 
 
180 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  35.2 
 
 
183 aa  114  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.87112e-10  decreased coverage  6.9205e-08 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  34.27 
 
 
182 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  1.14136e-06 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  38.85 
 
 
189 aa  110  1e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  37.56 
 
 
191 aa  107  9e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  42.76 
 
 
191 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  36.67 
 
 
257 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  37.36 
 
 
197 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  42.54 
 
 
202 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  34.54 
 
 
193 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  32.99 
 
 
192 aa  101  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  40.13 
 
 
203 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  32.4 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  7.573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.58 
 
 
253 aa  99  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.09479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  37.04 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  38.8 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  31.18 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  32.2 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  5.57218e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  42.34 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  33.13 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  32.78 
 
 
218 aa  94.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  31.35 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  38.04 
 
 
198 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  38.6 
 
 
200 aa  92  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  35 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  35.37 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  35.11 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.36885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  32.24 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.32 
 
 
181 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  34.25 
 
 
204 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  42.14 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  32.97 
 
 
245 aa  88.6  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  39.58 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  30.25 
 
 
190 aa  88.2  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  36.05 
 
 
193 aa  87.8  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.63106e-07  unclonable  1.37407e-10 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  34.25 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  31.82 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  31.87 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  32.58 
 
 
251 aa  85.1  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
192 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  30.48 
 
 
184 aa  85.1  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  36.88 
 
 
192 aa  84  1e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  35.64 
 
 
214 aa  81.6  7e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  31.11 
 
 
205 aa  81.6  7e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  31.67 
 
 
205 aa  79.7  2e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  37.01 
 
 
186 aa  80.1  2e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
190 aa  80.1  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  34.97 
 
 
195 aa  80.5  2e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  34.97 
 
 
195 aa  79.3  3e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  31.87 
 
 
207 aa  78.6  6e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  31.49 
 
 
205 aa  78.2  7e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  33.52 
 
 
209 aa  77.8  1e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  32.89 
 
 
241 aa  75.5  5e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.58134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  34.44 
 
 
193 aa  75.1  6e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  4.9462e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  32.77 
 
 
205 aa  74.7  7e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  31.58 
 
 
242 aa  73.9  1e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.23866e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  32.19 
 
 
244 aa  73.9  1e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  39.07 
 
 
203 aa  74.3  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  28.04 
 
 
190 aa  73.6  2e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  29.22 
 
 
193 aa  73.6  2e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  32.77 
 
 
233 aa  72.4  4e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.29313e-06  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  28.42 
 
 
188 aa  72  5e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
186 aa  71.2  9e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  33.13 
 
 
182 aa  70.9  1e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  31.64 
 
 
205 aa  70.5  2e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  32.2 
 
 
205 aa  70.1  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  27.87 
 
 
188 aa  70.1  2e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  31.19 
 
 
213 aa  68.9  4e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  33.52 
 
 
186 aa  67.4  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  33.6 
 
 
257 aa  67  2e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.45405e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  31.47 
 
 
153 aa  66.2  3e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  34.44 
 
 
184 aa  66.2  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  39.44 
 
 
184 aa  65.5  5e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  34.59 
 
 
188 aa  65.5  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  34.87 
 
 
194 aa  64.7  7e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  29.75 
 
 
195 aa  63.9  1e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  62.4  4e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  32.68 
 
 
188 aa  61.6  7e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  7.68463e-06  decreased coverage  7.90424e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>