More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3717 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  74.49 
 
 		 269 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  44.26 
 
 		 263 aa  166  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  44.68 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  41.94 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  41.94 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  45.39 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  45.24 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  44.51 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  40.28 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  44.51 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  43.35 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  38.31 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  37.17 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  41.04 
 
 		 354 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  34.07 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  41.04 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 		 339 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  37.64 
 
 		 242 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  34.22 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  34.94 
 
 		 624 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  36.18 
 
 		 876 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 671 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 671 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  31.78 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  37.11 
 
 		 652 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  44.65 
 
 		 664 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  37.43 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  38 
 
 		 652 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  38.1 
 
 		 671 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  29.96 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  34.66 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  36.91 
 
 		 196 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  32.45 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  37.2 
 
 		 553 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  34.94 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  31.6 
 
 		 227 aa  95.5  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  34.19 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 188 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  37.67 
 
 		 629 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 		 182 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  28.87 
 
 		 220 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  28.74 
 
 		 218 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  31.28 
 
 		 613 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  31.12 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  31.28 
 
 		 613 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  31.28 
 
 		 613 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 182 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 		 224 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  33.73 
 
 		 616 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 224 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  37.18 
 
 		 172 aa  89  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  27.84 
 
 		 220 aa  89  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  36.54 
 
 		 398 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 182 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  28.85 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  31.18 
 
 		 207 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  31.36 
 
 		 630 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.41 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  33.33 
 
 		 223 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  31.35 
 
 		 223 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  33.33 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 220 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.4 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 179 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  31.02 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>