73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3703 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  100 
 
 		 4022 aa  8097    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  96.09 
 
 		 4009 aa  7591    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  27.49 
 
 		 4357 aa  261  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  32.82 
 
 		 3861 aa  248  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  32.78 
 
 		 3822 aa  235  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  30 
 
 		 3907 aa  205  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  45.24 
 
 		 3544 aa  92  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  43.55 
 
 		 2522 aa  89  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  45.16 
 
 		 3699 aa  85.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.35 
 
 		 3699 aa  85.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  45.63 
 
 		 2476 aa  76.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  46.6 
 
 		 2503 aa  74.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  33.97 
 
 		 14609 aa  71.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  44.33 
 
 		 3474 aa  69.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 692 aa  67  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  38.95 
 
 		 830 aa  64.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  35.76 
 
 		 1188 aa  64.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  36 
 
 		 2636 aa  63.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.5 
 
 		 11716 aa  61.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  34.81 
 
 		 1831 aa  61.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  55.38 
 
 		 1107 aa  60.1  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.04 
 
 		 841 aa  59.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  35.88 
 
 		 2701 aa  59.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  32.82 
 
 		 2853 aa  58.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  34.72 
 
 		 3598 aa  58.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  35.82 
 
 		 4465 aa  58.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.12 
 
 		 994 aa  58.2  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  38.02 
 
 		 1394 aa  57.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  32.82 
 
 		 2820 aa  57.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  42.55 
 
 		 1908 aa  57.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.52 
 
 		 3325 aa  57.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  30.14 
 
 		 4231 aa  57.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1316 aa  57  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.77 
 
 		 761 aa  57  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  32.08 
 
 		 2074 aa  56.6  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.89 
 
 		 950 aa  56.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  29.03 
 
 		 5020 aa  55.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  35.62 
 
 		 2334 aa  55.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  35 
 
 		 2233 aa  54.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1589 aa  54.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  32.7 
 
 		 1446 aa  53.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  28.09 
 
 		 731 aa  53.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  33.33 
 
 		 5743 aa  53.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1487 aa  53.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  41.18 
 
 		 3027 aa  53.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  30.25 
 
 		 1224 aa  53.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.78 
 
 		 850 aa  52  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  31.5 
 
 		 1141 aa  52  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 2135 aa  51.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3070  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  31.85 
 
 		 315 aa  50.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.722808  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  33.33 
 
 		 2542 aa  50.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 		 440 aa  50.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 462 aa  50.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  33.12 
 
 		 675 aa  50.1  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.69 
 
 		 2377 aa  50.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  39.6 
 
 		 474 aa  48.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  32.73 
 
 		 2001 aa  48.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  41.67 
 
 		 2117 aa  48.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0462  hypothetical protein  33.08 
 
 		 618 aa  48.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271828  normal  0.328949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.8 
 
 		 1779 aa  47.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 319 aa  47.8  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.47 
 
 		 1884 aa  47.8  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  34.78 
 
 		 792 aa  48.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1987 aa  47.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.43 
 
 		 1407 aa  47.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1051 aa  47.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.51 
 
 		 12684 aa  47.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  29.73 
 
 		 1332 aa  47  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  54.29 
 
 		 2145 aa  47  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1744 aa  47  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  36.18 
 
 		 1269 aa  47  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  40.62 
 
 		 1706 aa  46.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.29 
 
 		 2507 aa  46.6  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>