More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3651 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
380 aa  776    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  69.92 
 
 
380 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  47.08 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  44.63 
 
 
376 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  45.14 
 
 
380 aa  302  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  45.31 
 
 
380 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  44.77 
 
 
380 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  44.77 
 
 
380 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  44.77 
 
 
380 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  44.51 
 
 
370 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  43.7 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  43.13 
 
 
466 aa  282  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  42.97 
 
 
371 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  44.96 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  41.97 
 
 
361 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  39.29 
 
 
362 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  42.73 
 
 
338 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  39.27 
 
 
409 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  44.12 
 
 
354 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  36.49 
 
 
363 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  35.68 
 
 
363 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  35.68 
 
 
363 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  35.95 
 
 
363 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  35.95 
 
 
363 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  35.68 
 
 
363 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  35.68 
 
 
363 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  35.41 
 
 
363 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  35.41 
 
 
363 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  36.99 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  35.68 
 
 
363 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  36.29 
 
 
395 aa  223  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  36.92 
 
 
399 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  36.67 
 
 
399 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  37.47 
 
 
402 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  36.51 
 
 
401 aa  216  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  37.66 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  34.54 
 
 
395 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.92 
 
 
399 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  37.47 
 
 
405 aa  211  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.73 
 
 
399 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  35.73 
 
 
399 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  36.73 
 
 
370 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  37 
 
 
370 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.99 
 
 
406 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2202  transposase, IS605 OrfB family  36.19 
 
 
417 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0822  putative transposase IS605 family  34.56 
 
 
411 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0682059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3231  putative transposase IS605 family  34.56 
 
 
411 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963843 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  34.76 
 
 
370 aa  195  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  34.49 
 
 
370 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  35.37 
 
 
394 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  34.93 
 
 
370 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1635  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.36 
 
 
403 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  35.44 
 
 
410 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  34.76 
 
 
370 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  33.25 
 
 
449 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  38.01 
 
 
368 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  34.95 
 
 
370 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  36.24 
 
 
390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  32.9 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  32.9 
 
 
384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  33.78 
 
 
370 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  34.32 
 
 
370 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  34.23 
 
 
370 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  32.64 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  32.9 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  32.9 
 
 
384 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  34.76 
 
 
393 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  38.14 
 
 
410 aa  189  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  35.9 
 
 
383 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  33.96 
 
 
370 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  32.64 
 
 
384 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  32.11 
 
 
383 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  32.64 
 
 
384 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  31.85 
 
 
384 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  32.55 
 
 
384 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  34.67 
 
 
393 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  32.38 
 
 
384 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  32.38 
 
 
384 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  32.38 
 
 
384 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  32.11 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  32.07 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  32.07 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  32.07 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  32.89 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  32.07 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  35.22 
 
 
376 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  31.59 
 
 
384 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.63 
 
 
381 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  32.07 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0873  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  33.74 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3144  transposase, IS605 OrfB family  35.11 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.545249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 
440 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  31.33 
 
 
384 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  36.76 
 
 
416 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4459  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  36.01 
 
 
410 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0042  transposase  35.29 
 
 
362 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580929  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  33.95 
 
 
373 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.95 
 
 
372 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  33.6 
 
 
393 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>