257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3646 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 507 aa  1027    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 327 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 314 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 324 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 292 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.86 
 
 		 1162 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.76 
 
 		 1161 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 1061 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  29.61 
 
 		 181 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07290  hypothetical protein  26.09 
 
 		 260 aa  70.1  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.43943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 368 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 244 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  26.79 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  28.75 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 305 aa  63.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.75 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 235 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  29.17 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  28 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  41.56 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  29.91 
 
 		 308 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 308 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 225 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  39.47 
 
 		 224 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  27.1 
 
 		 280 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1965  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 235 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 1190 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  38.1 
 
 		 255 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 1759 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 662 aa  54.3  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  38.24 
 
 		 213 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 		 303 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.15 
 
 		 1191 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 		 242 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  38.27 
 
 		 258 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 222 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 237 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  35.16 
 
 		 1644 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  35.16 
 
 		 1644 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  32.79 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 242 aa  52.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 239 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  30.15 
 
 		 1182 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  32.91 
 
 		 241 aa  51.6  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  53.66 
 
 		 238 aa  50.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 1359 aa  50.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.92 
 
 		 337 aa  50.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 		 513 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  34.52 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 1162 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.42 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  30 
 
 		 239 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3174  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 229 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  52.38 
 
 		 241 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 346 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 257 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1124 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 349 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 		 851 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1209  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 210 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 		 851 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 706 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 710 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3993  hypothetical protein  31.96 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 1193 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 282 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 210 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 		 851 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 230 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>