More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3636 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
322 aa  645  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  81.99 
 
 
334 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 
261 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 
336 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  43.97 
 
 
278 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
1177 aa  164  2e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
1177 aa  164  2e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  44.66 
 
 
260 aa  162  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.63 
 
 
642 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
1032 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  43.07 
 
 
253 aa  156  5e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
777 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  33.77 
 
 
272 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  41.95 
 
 
773 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  40.29 
 
 
316 aa  140  4e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
268 aa  139  9e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
293 aa  132  8e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  38.84 
 
 
340 aa  130  4e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
738 aa  128  1e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 
756 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
253 aa  127  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.29 
 
 
312 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 
338 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
350 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
318 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  40.28 
 
 
544 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
305 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2150  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
302 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
347 aa  120  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  48.46 
 
 
330 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.20628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
327 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
330 aa  120  4e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
299 aa  120  4e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
1035 aa  119  5e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
318 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
373 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
352 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  37.02 
 
 
1476 aa  119  1e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
321 aa  119  1e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
380 aa  117  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.92 
 
 
255 aa  117  2e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
374 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
296 aa  116  7e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
333 aa  116  7e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
361 aa  115  8e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
357 aa  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 
338 aa  115  1e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.6 
 
 
330 aa  115  1e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
347 aa  114  2e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  36.03 
 
 
689 aa  114  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
953 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  32.22 
 
 
299 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  9.37683e-12 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
350 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
262 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
345 aa  113  4e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
390 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  32.64 
 
 
300 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
336 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
501 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
329 aa  112  7e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 
663 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
329 aa  112  1e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
261 aa  111  2e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  37 
 
 
573 aa  111  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 
390 aa  111  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
349 aa  111  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
303 aa  110  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
294 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
353 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
398 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
300 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
294 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
347 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
314 aa  109  7e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
294 aa  109  7e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
351 aa  109  8e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
320 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
324 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.5 
 
 
321 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  32.74 
 
 
294 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
209 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
294 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 
295 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
339 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
342 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 
294 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
335 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
327 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
344 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
337 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
373 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
300 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
306 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.19 
 
 
349 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
704 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
341 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
397 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 
329 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
316 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
351 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>