92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3607 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  84.55 
 
 		 221 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  53.14 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  37.02 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  34.6 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  37.5 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  37.56 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  36.36 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  45.89 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  35.9 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  39.47 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  38.66 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  40.19 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  38.46 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  34.47 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  35.11 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  34.6 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  33.65 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  33.51 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  34.1 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  33.51 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  33.51 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  33.51 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  31.8 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  32.8 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  31.89 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  30.88 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  32.43 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  32.43 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  31.89 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  33.64 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  31.63 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  29.05 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  30.69 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  35.35 
 
 		 272 aa  87.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  32.46 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  33.88 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  31.34 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  30.73 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  30.73 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  26.22 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  29.57 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  28.4 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  31.47 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  31.47 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  29.26 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  37.97 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  27.98 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  31.46 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  28.34 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  28.34 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  31.47 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  25.51 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  32.89 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  26.92 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  31.53 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  30.89 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  31.22 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  25.13 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  34.5 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  27.17 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  24.47 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  28.85 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  28.85 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  25.15 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  30.81 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  29.85 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  31.52 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  31.52 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  29.95 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  30.48 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01170  thiamine pyrophosphokinase, putative  26.4 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772914  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  23.81 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  33.05 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  31.32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  32.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  29.95 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  24.32 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  26.8 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  31.11 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  47.69 
 
 		 390 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.61 
 
 		 382 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  62.07 
 
 		 395 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  54.29 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.75 
 
 		 371 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  52.63 
 
 		 371 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.65 
 
 		 404 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  25.64 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>