More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3589 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  100 
 
 		 404 aa  774    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  86.88 
 
 		 404 aa  618  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  66 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  53.52 
 
 		 405 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  46.84 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  45.86 
 
 		 419 aa  311  9e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  45.92 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  47.98 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  50.79 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  47.42 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  39.79 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  43.64 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  42.31 
 
 		 429 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  42.34 
 
 		 429 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  41.49 
 
 		 413 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  42.2 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  36.87 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  37.53 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  38 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  38.18 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  32.06 
 
 		 423 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.66 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  28.79 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  32.18 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  33.42 
 
 		 417 aa  159  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  29.47 
 
 		 422 aa  159  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  28.89 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  31.65 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.77 
 
 		 421 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  30.24 
 
 		 423 aa  156  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  29.44 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  27 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  31.25 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  29.21 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  30.1 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  34.18 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  28.92 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  28.49 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  32.65 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  30.35 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  29.93 
 
 		 441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  31.46 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  31.05 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  29.43 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  29.85 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  29.85 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  32.72 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  29.05 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  29.17 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  28.89 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  29.43 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  29.43 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  29.43 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  29.43 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  29.05 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  29.46 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  29.02 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  29.14 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  29.38 
 
 		 441 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  29.38 
 
 		 444 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  29.38 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  28.81 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  30.42 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  32.41 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  29.66 
 
 		 441 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  28.86 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  29.38 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  29.66 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  29.66 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  29.66 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  29.66 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.03 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  29.59 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  30.77 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  25.66 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  28.64 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  26.6 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  30.36 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  28.03 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  28.03 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  27.27 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.59 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.9 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  28.61 
 
 		 424 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  26.23 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  29.9 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  28.39 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  29.35 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  27.23 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  27.03 
 
 		 577 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  27.61 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  34.39 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  26.27 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  25.46 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  28.92 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  28.38 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.01 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  28.46 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  26.42 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>