207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3586 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  79.33 
 
 
719 aa  1073    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
721 aa  1413    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  38.49 
 
 
521 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  33.9 
 
 
920 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  29.04 
 
 
523 aa  93.6  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  33.2 
 
 
329 aa  91.3  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  37.5 
 
 
512 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  25.95 
 
 
558 aa  90.5  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  31.91 
 
 
505 aa  87.4  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  29.6 
 
 
555 aa  87.4  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  37.38 
 
 
512 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  33.33 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  36.32 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  36.81 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  37.38 
 
 
489 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  37.38 
 
 
489 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.43 
 
 
519 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  35.92 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  36.63 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  29.92 
 
 
524 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  33.65 
 
 
492 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  36.63 
 
 
508 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  32.4 
 
 
596 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.21 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  32.51 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  35.71 
 
 
498 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.01 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  36.05 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  22.8 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  29.8 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  36.02 
 
 
513 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  36.25 
 
 
503 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.67 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  33.18 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  29.64 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  36.17 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  31.34 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  35.47 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  35.47 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  35.62 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  34.97 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  35.47 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  34.12 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  26.82 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  32.23 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  35.68 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  34.12 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  34.62 
 
 
508 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  35.21 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  35.21 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  30.29 
 
 
519 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  35.21 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  30.28 
 
 
505 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  35.21 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  31.05 
 
 
505 aa  73.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.63 
 
 
510 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  35 
 
 
503 aa  72  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  30 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  26.05 
 
 
522 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  35.21 
 
 
433 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  31.73 
 
 
512 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  35.21 
 
 
433 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0458  adenylate cyclase  31.86 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  31.05 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.92 
 
 
511 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  28.82 
 
 
495 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  31.22 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  34.53 
 
 
291 aa  69.3  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  33.33 
 
 
347 aa  69.7  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  34.26 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  28.57 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  34.45 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  31.73 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  34.93 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  34.93 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  34.93 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  28.06 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  34.93 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  31.73 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  28.14 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  32.52 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  31.75 
 
 
215 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  33.49 
 
 
510 aa  66.6  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  32.28 
 
 
213 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  31.75 
 
 
215 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  29.82 
 
 
291 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.13 
 
 
490 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  30.97 
 
 
327 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  38.01 
 
 
207 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  28.51 
 
 
309 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  23.6 
 
 
322 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  24.43 
 
 
517 aa  65.1  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  21.93 
 
 
338 aa  64.7  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  31.72 
 
 
331 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  31.45 
 
 
598 aa  64.3  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  29.86 
 
 
510 aa  64.3  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  32.37 
 
 
517 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  32.45 
 
 
213 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  33.14 
 
 
208 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  30.88 
 
 
514 aa  63.9  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>