More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3500 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4104  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  40.55 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.58 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 291 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5339  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 289 aa  168  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1967  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207347  normal  0.0517862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4852  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.77 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.29 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.9 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.56 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.11 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.25 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 289 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  33.22 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.56 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.49 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  31.77 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  33 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.11 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>