79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3437 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  100 
 
 
666 aa  1340    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  74.4 
 
 
666 aa  996    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3357  hypothetical protein  47.83 
 
 
666 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00235574  hitchhiker  0.000266176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3339  hypothetical protein  33.38 
 
 
620 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  32.02 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  42.11 
 
 
770 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  33.71 
 
 
751 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  33.73 
 
 
768 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  33.12 
 
 
918 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  36.31 
 
 
764 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.76 
 
 
744 aa  81.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3710  hypothetical protein  27.27 
 
 
747 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  30.64 
 
 
781 aa  78.2  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  31.69 
 
 
938 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  31.71 
 
 
806 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  32.74 
 
 
763 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  32.74 
 
 
763 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  30.8 
 
 
927 aa  70.5  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.41 
 
 
747 aa  68.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  31.91 
 
 
771 aa  67.8  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  30.39 
 
 
746 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.65 
 
 
1045 aa  65.1  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.85 
 
 
1034 aa  63.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.48 
 
 
1034 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  31.41 
 
 
799 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
1309 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  30.77 
 
 
799 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  30.23 
 
 
799 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  31.16 
 
 
924 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  30.77 
 
 
799 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  30.23 
 
 
799 aa  60.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  30.77 
 
 
799 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  30.23 
 
 
799 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  30.77 
 
 
799 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  29.89 
 
 
795 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  29.19 
 
 
825 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  30.13 
 
 
799 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  30.77 
 
 
796 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  27.62 
 
 
795 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  26.34 
 
 
760 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  24.46 
 
 
965 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  26.15 
 
 
945 aa  58.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  30.67 
 
 
566 aa  57.4  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  29.49 
 
 
795 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  29.49 
 
 
795 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  26.42 
 
 
865 aa  54.7  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  27.04 
 
 
812 aa  54.3  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  23.96 
 
 
936 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  27.67 
 
 
794 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  25.97 
 
 
795 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  27.04 
 
 
794 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  27.04 
 
 
795 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  23.44 
 
 
936 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  27.04 
 
 
795 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  29.03 
 
 
795 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  28.66 
 
 
795 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  28.49 
 
 
938 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  29.03 
 
 
795 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  28.66 
 
 
795 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  29.3 
 
 
796 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  26.11 
 
 
763 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  29.68 
 
 
796 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  29.3 
 
 
796 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  26.92 
 
 
574 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  30.09 
 
 
982 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  26.2 
 
 
856 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  23.53 
 
 
871 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  27.17 
 
 
869 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  23.53 
 
 
867 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  23.68 
 
 
935 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  24.38 
 
 
865 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  28.47 
 
 
984 aa  48.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.49 
 
 
1074 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  25.67 
 
 
951 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  32.29 
 
 
868 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  29.41 
 
 
1367 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  26.72 
 
 
1378 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1534  Peptidase M30, hyicolysin  25.43 
 
 
390 aa  43.9  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0271  Peptidase M30, hyicolysin  21.18 
 
 
413 aa  43.9  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>