109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3408 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3408  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
87 aa  174  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.350756  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1557  cell division topological specificity factor MinE  91.86 
 
 
87 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3785  cell division topological specificity factor MinE  63.95 
 
 
91 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  0.0155395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3423  cell division topological specificity factor MinE  63.22 
 
 
87 aa  107  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00102224  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1204  cell division topological specificity factor MinE  42.5 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4345  cell division topological specificity factor MinE  40 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  44.78 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  44.78 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03561  cell division topological specificity factor MinE  39.02 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.217865  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3333  cell division topological specificity factor MinE  37.97 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0369939  normal  0.713516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0480  cell division topological specificity factor MinE  38.27 
 
 
102 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.689847  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1854  cell division topological specificity factor MinE  36.9 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0713629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1533  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.183546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1398  cell division topological specificity factor MinE  34.18 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000955334  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0897  cell division topological specificity factor MinE  35 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0560402  hitchhiker  0.00587681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21901  cell division topological specificity factor MinE  35.71 
 
 
126 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.892996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0094  cell division topological specificity factor MinE  35.71 
 
 
94 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000217477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2542  cell division topological specificity factor MinE  38.55 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.958579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1282  cell division topological specificity factor MinE  38.75 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0546704  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2557  cell division topological specificity factor MinE  32.94 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000283914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2128  cell division topological specificity factor MinE  32.53 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000173264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0521  cell division topological specificity factor MinE  36.11 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.617236  hitchhiker  0.000386475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1460  cell division topological specificity factor MinE  36.14 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.799074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14180  cell division topological specificity factor MinE  37.14 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.96332e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0543  cell division topological specificity factor MinE  37.21 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000190425  normal  0.758266 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03441  cell division topological specificity factor MinE  34.52 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61963  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03521  cell division topological specificity factor MinE  34.52 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3373  cell division topological specificity factor MinE  45.68 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0326  cell division topological specificity factor MinE  34.52 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03461  cell division topological specificity factor MinE  34.52 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2369  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0155059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1307  cell division topological specificity factor MinE  35.53 
 
 
100 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000125469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1635  septum site-determining protein  37.8 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0732475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0551  cell division topological specificity factor MinE  38.36 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2104  cell division topological specificity factor MinE  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000684529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2034  cell division topological specificity factor MinE  35.37 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0933  cell division topological specificity factor MinE  35.53 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.533216 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1697  cell division topological specificity factor MinE  35.37 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.743987  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04121  cell division topological specificity factor MinE  35.37 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0552098  normal  0.388875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2392  cell division topological specificity factor MinE  27.78 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000829737  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1553  cell division topological specificity factor MinE  40.79 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326791  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  31.71 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1352  cell division topological specificity factor MinE  32.1 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0634  cell division topological specificity factor MinE  35.44 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0371939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  34.94 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  34.94 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0869  cell division topological specificity factor MinE  29.27 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3479  cell division topological specificity factor MinE  31.87 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0837361  normal  0.579917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0503  cell division topological specificity factor MinE  37.5 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.92083  normal  0.0267759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  32.1 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1269  cell division topological specificity factor MinE  38.89 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2769  cell division topological specificity factor MinE  31.76 
 
 
96 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.296613  normal  0.0661713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1219  cell division topological specificity factor MinE  37.33 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3348  cell division topological specificity factor MinE  31.76 
 
 
96 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3018  cell division topological specificity factor MinE  29.76 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1430  cell division topological specificity factor MinE  38.89 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  32.53 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6588  cell division topological specificity factor MinE  38.27 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  hitchhiker  0.00722875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  30.86 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  36.14 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  30.34 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  30.34 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  31.33 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  32.93 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  37.84 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5652  cell division topological specificity factor MinE  38.27 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1258  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0812089  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  28.05 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3031  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.82909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1979  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0967  cell division topological specificity factor MinE  37.33 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0657  cell division topological specificity factor MinE  36.14 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421809  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  31.76 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  35.37 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  35.37 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1994  cell division topological specificity factor MinE  30.77 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.829432  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0323  cell division topological specificity factor MinE  34.15 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0226331  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0296  cell division topological specificity factor MinE  34.15 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00745796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3687  cell division topological specificity factor MinE  36.49 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54305  hitchhiker  0.000223876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3506  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0458207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0062  cell division topological specificity factor MinE  32.53 
 
 
84 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.301009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0321  cell division topological specificity factor MinE  37.97 
 
 
87 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.332836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3384  cell division topological specificity factor MinE  27.91 
 
 
95 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1316  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  28.4 
 
 
85 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  31.33 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  32.53 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>