25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3397 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 
231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  86.6 
 
 
228 aa  335  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  60.19 
 
 
208 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  62.94 
 
 
222 aa  238  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  47.09 
 
 
216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  48.4 
 
 
217 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  48.4 
 
 
217 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  48.4 
 
 
210 aa  168  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  40.53 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  35.58 
 
 
208 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  33.68 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  34.15 
 
 
208 aa  111  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.57 
 
 
204 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  31.76 
 
 
197 aa  92.8  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.21 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.62 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  27.37 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  24.87 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  24.35 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  23.32 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0637  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.7 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.611822  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.77 
 
 
189 aa  58.9  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.53 
 
 
192 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.24 
 
 
204 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  24.82 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>