81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3394 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  84.79 
 
 		 621 aa  1020    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1253    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  47.74 
 
 		 568 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  46.21 
 
 		 595 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  47.93 
 
 		 532 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  46.17 
 
 		 538 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  45.57 
 
 		 534 aa  402  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.73 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  48.16 
 
 		 527 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  46.72 
 
 		 532 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  46.17 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  46.72 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  40.54 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  47.22 
 
 		 549 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  28.71 
 
 		 660 aa  178  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 676 aa  176  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  28.3 
 
 		 675 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  27.44 
 
 		 669 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  27.8 
 
 		 692 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 661 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  25.79 
 
 		 679 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  27.19 
 
 		 696 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  27.34 
 
 		 696 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  25.63 
 
 		 679 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  30.45 
 
 		 582 aa  140  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  27.57 
 
 		 691 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  29.64 
 
 		 595 aa  133  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  27.94 
 
 		 599 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  28.8 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  28.82 
 
 		 584 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  28.93 
 
 		 595 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  28.75 
 
 		 595 aa  107  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  27.37 
 
 		 601 aa  95.5  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  28.32 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  25.26 
 
 		 624 aa  83.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  24.66 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.03 
 
 		 764 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  22.8 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  23.37 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  36.18 
 
 		 748 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  24.41 
 
 		 668 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  24.21 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  23.82 
 
 		 757 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  24.05 
 
 		 764 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  23.17 
 
 		 641 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  21.64 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  25.13 
 
 		 672 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  24.08 
 
 		 600 aa  63.9  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  24.62 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  22.83 
 
 		 549 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  24.57 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  34.46 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  24.11 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.66 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  22.8 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  23.78 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  22.6 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.74 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  23.67 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  21.01 
 
 		 457 aa  54.7  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.9 
 
 		 722 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  27.97 
 
 		 763 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.86 
 
 		 445 aa  53.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  25 
 
 		 432 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  33.56 
 
 		 478 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  22.03 
 
 		 550 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  27.2 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  27.67 
 
 		 761 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.26 
 
 		 600 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  23.11 
 
 		 448 aa  47.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.61 
 
 		 431 aa  47.4  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 		 453 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  20.82 
 
 		 618 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  30.71 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  29.76 
 
 		 784 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 		 441 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>