105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3375 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  98.38 
 
 
245 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  98.92 
 
 
259 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  96.22 
 
 
259 aa  367  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  76.73 
 
 
200 aa  319  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  82.16 
 
 
245 aa  315  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  78.92 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  64.31 
 
 
258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  65.84 
 
 
244 aa  304  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  63.49 
 
 
230 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  58.19 
 
 
230 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  60.42 
 
 
217 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  60.52 
 
 
222 aa  275  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  71.81 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  52.72 
 
 
229 aa  269  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  51.6 
 
 
260 aa  261  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  51.72 
 
 
243 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  55.56 
 
 
239 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  51.29 
 
 
229 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  53.22 
 
 
232 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  53.54 
 
 
248 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  51.68 
 
 
229 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  53.54 
 
 
248 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  51.29 
 
 
218 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  51.69 
 
 
250 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  51.69 
 
 
250 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  47.64 
 
 
217 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  48.07 
 
 
217 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  51.71 
 
 
227 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  49.21 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  61.25 
 
 
114 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  34.1 
 
 
274 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  31.2 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  31.02 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  31.28 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  33.51 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  26.21 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  26.21 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  28.93 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  29.49 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  27.84 
 
 
243 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
238 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  27.84 
 
 
243 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  28.51 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  28.51 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  26.18 
 
 
284 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  27 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  29.88 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  32.04 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  31.49 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  28.33 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  36.22 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  26.97 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  30.8 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  27.46 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  24.02 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  24.38 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  29.39 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  26.5 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  29.58 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  25.12 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  25.26 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  23.92 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  23.81 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  29.03 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  28.31 
 
 
330 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  28.31 
 
 
332 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  28.31 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  34.57 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  28.63 
 
 
319 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  43.4 
 
 
195 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  31.48 
 
 
259 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  27.63 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  23.13 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  33.18 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  30 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  35.94 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  27.53 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  27.54 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  25.31 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  29.87 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.16 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  40.58 
 
 
182 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  27.16 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  51.35 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  35.14 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  26.32 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  28.21 
 
 
190 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  47.37 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  28.21 
 
 
302 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  30.81 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  33.77 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>