103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3372 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  510  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  96.22 
 
 
245 aa  367  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  96.22 
 
 
259 aa  367  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  96.22 
 
 
245 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  83.78 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  80 
 
 
265 aa  316  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  75.62 
 
 
200 aa  315  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  65.37 
 
 
258 aa  306  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  63.92 
 
 
244 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  61.57 
 
 
230 aa  287  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  56.33 
 
 
230 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  52.16 
 
 
260 aa  278  8e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  61.57 
 
 
259 aa  275  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  58.04 
 
 
217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  56.02 
 
 
229 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  57.55 
 
 
222 aa  268  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  49.59 
 
 
243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  51.98 
 
 
239 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  51.87 
 
 
248 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  51.87 
 
 
248 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  49.8 
 
 
232 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  48.39 
 
 
229 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  48.81 
 
 
218 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  48.21 
 
 
229 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  48.41 
 
 
250 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  48.41 
 
 
250 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  52.85 
 
 
217 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  53.37 
 
 
217 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  46.46 
 
 
227 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  44.91 
 
 
232 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  35.66 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  62.2 
 
 
114 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  32.32 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  33.49 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 
245 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  30.21 
 
 
238 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  26.25 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  26.25 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  28.52 
 
 
284 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  28.2 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  29.92 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  29.13 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  28.2 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  32.42 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  31.87 
 
 
235 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  27.13 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  36.72 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  31.06 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  26.95 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  26.14 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  27.51 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  26.84 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  27.76 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  25.99 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  25.53 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  24.81 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  34.09 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  25.97 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  31.6 
 
 
319 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  25.95 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  25.28 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  27.43 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  26.54 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  25.61 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  26.37 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  27.67 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  28.64 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  28.64 
 
 
319 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  28.64 
 
 
330 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  36.14 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  27.65 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  27.63 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  44.9 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  31.94 
 
 
241 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  35.94 
 
 
195 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  21.71 
 
 
187 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  36 
 
 
187 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  35.85 
 
 
187 aa  45.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  28.4 
 
 
184 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  32.26 
 
 
252 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  29.87 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  28.27 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
193 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  42.86 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  51.35 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  30.61 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  31.48 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  25.69 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  26.46 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  34.04 
 
 
187 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  33.73 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  23.17 
 
 
181 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  47.37 
 
 
188 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>