129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3329 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  79.9 
 
 		 500 aa  701    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 453 aa  927    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.11 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.5 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.06 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.62 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  36.03 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  38.1 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  32.96 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  36.23 
 
 		 283 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  33.99 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  29.39 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1411  hypothetical protein  37.18 
 
 		 886 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.3 
 
 		 262 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  37.5 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  32.93 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  36.57 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  35.82 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  34 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  32.94 
 
 		 306 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.07 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.82 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  31.58 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  28.66 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  26.99 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  32.14 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  31.64 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.11 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  45.21 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  32.89 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.68 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  29.52 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.52 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.34 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  30.68 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.23 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1704  hypothetical protein  35.25 
 
 		 886 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.298194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  30.26 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  31.4 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  42.47 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.03 
 
 		 722 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  32.59 
 
 		 662 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.18 
 
 		 597 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  32.26 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.2 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  32.71 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  30.92 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.03 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  37.5 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  30.72 
 
 		 459 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.68 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  27.44 
 
 		 635 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  39 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.42 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  36.73 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  36.73 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  33.57 
 
 		 235 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  39 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  31.52 
 
 		 490 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  33.12 
 
 		 862 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  27.62 
 
 		 235 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  27.89 
 
 		 237 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  32.92 
 
 		 801 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.85 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  32.92 
 
 		 803 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  30.4 
 
 		 249 aa  50.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  35.71 
 
 		 400 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.97 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.69 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.78 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  29.68 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  31.21 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.41 
 
 		 355 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  26.46 
 
 		 879 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  68.97 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.97 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.73 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.53 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.52 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  28.07 
 
 		 804 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  21.94 
 
 		 388 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.38 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.74 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.74 
 
 		 381 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.04 
 
 		 393 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.7 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  26.77 
 
 		 256 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  32.41 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  28.76 
 
 		 601 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  25.91 
 
 		 256 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  40.58 
 
 		 239 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  32.26 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.71 
 
 		 889 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  35.44 
 
 		 239 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  38.54 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  23.38 
 
 		 262 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  37.88 
 
 		 242 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>