More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3326 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  93.46 
 
 
468 aa  887  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
474 aa  943  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  63.26 
 
 
462 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  5.22922e-05  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  47.28 
 
 
538 aa  400  1e-110  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  43.17 
 
 
515 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  38.88 
 
 
461 aa  283  4e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  40.35 
 
 
471 aa  282  8e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  40.58 
 
 
470 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  40.58 
 
 
470 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  38.91 
 
 
464 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  38.03 
 
 
474 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  36.14 
 
 
470 aa  266  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 
464 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  35.67 
 
 
416 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  38.91 
 
 
495 aa  260  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  37.85 
 
 
493 aa  259  9e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  36.6 
 
 
403 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  35.27 
 
 
461 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 
411 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  35.28 
 
 
735 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  36.62 
 
 
413 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.93049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  35.78 
 
 
410 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  38.38 
 
 
449 aa  247  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  4.78055e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  37.34 
 
 
449 aa  246  7e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.19854e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  37.94 
 
 
449 aa  244  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  35.48 
 
 
489 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  33.12 
 
 
486 aa  243  4e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  33.95 
 
 
406 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 
411 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.72302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 
403 aa  240  3e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.90493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  37.36 
 
 
495 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  36.24 
 
 
399 aa  239  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 
533 aa  234  2e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  34.23 
 
 
496 aa  233  4e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  34.02 
 
 
496 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  36.46 
 
 
533 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.95 
 
 
532 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  38.16 
 
 
457 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  37.08 
 
 
534 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  32.67 
 
 
489 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 
530 aa  226  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  36.1 
 
 
533 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  36.59 
 
 
594 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  36.59 
 
 
594 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  37.08 
 
 
535 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 
533 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  32.67 
 
 
489 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  32.25 
 
 
419 aa  223  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.22 
 
 
533 aa  222  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  38.17 
 
 
554 aa  221  1e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  31.03 
 
 
487 aa  222  1e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  32.25 
 
 
419 aa  221  2e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  37.15 
 
 
533 aa  221  2e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.86 
 
 
853 aa  221  2e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.72 
 
 
532 aa  221  2e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  33.86 
 
 
415 aa  220  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.18015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  36.59 
 
 
532 aa  220  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.15 
 
 
533 aa  219  9e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  36.02 
 
 
530 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 
759 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  1.07208e-07 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  37.53 
 
 
535 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  34.19 
 
 
533 aa  214  2e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  35.9 
 
 
531 aa  214  3e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.01 
 
 
554 aa  213  5e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  35.01 
 
 
554 aa  213  5e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.73 
 
 
848 aa  213  6e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.16 
 
 
856 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.46 
 
 
554 aa  213  8e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 
531 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.31 
 
 
525 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.37 
 
 
487 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  34.74 
 
 
554 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.12 
 
 
839 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  35.31 
 
 
533 aa  210  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.03 
 
 
849 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  31.03 
 
 
441 aa  209  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.45038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  34.25 
 
 
534 aa  209  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  34.2 
 
 
556 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  33.84 
 
 
532 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  34.03 
 
 
473 aa  206  8e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  33.85 
 
 
530 aa  206  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  34.01 
 
 
503 aa  206  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.36 
 
 
856 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.36 
 
 
844 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.84 
 
 
754 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.82789e-06 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.84 
 
 
754 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.06 
 
 
754 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.05 
 
 
754 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.05 
 
 
754 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.07 
 
 
532 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  34.97 
 
 
532 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  33.18 
 
 
613 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.61 
 
 
754 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.61 
 
 
754 aa  203  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.84 
 
 
754 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.61 
 
 
754 aa  202  1e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.09 
 
 
761 aa  201  2e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  33.41 
 
 
613 aa  201  2e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  33.59 
 
 
533 aa  201  2e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  35.4 
 
 
533 aa  201  2e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>