More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3324 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  100 
 
 		 244 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  71.43 
 
 		 245 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.29 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 354 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  27.39 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 1106 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  26.11 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 307 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  22.91 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.91 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.01 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.33 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  30.46 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  31.5 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30.07 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.12 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  29.37 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  31.5 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  31.5 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  22.84 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  30.4 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  32.43 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1703  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.59 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.11 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  31.67 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.73 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  29.25 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  29.25 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  29.25 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  31.78 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  29.25 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  30.39 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  31.78 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  29.69 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  35.71 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  29.25 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3428  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.49 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  29.69 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1674  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 329 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.91 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.38 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  31.78 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.69 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  30 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.54 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  31.37 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  30.56 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.03 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>