216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3312 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  100 
 
 
342 aa  692    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  79.18 
 
 
342 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  65.34 
 
 
354 aa  424  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  58.43 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  54.36 
 
 
344 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  53.53 
 
 
346 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  53.53 
 
 
346 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  52.33 
 
 
360 aa  358  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  48.7 
 
 
346 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  50.58 
 
 
355 aa  345  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  49.28 
 
 
352 aa  342  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  51 
 
 
352 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  50.42 
 
 
355 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  50.14 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  49.57 
 
 
352 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  51.45 
 
 
349 aa  332  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  48.27 
 
 
353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  51.27 
 
 
355 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  48.41 
 
 
350 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  48.01 
 
 
349 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  48.01 
 
 
349 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  35.95 
 
 
311 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.57 
 
 
311 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  35.12 
 
 
307 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  34.32 
 
 
333 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  31.44 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  33.14 
 
 
315 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  30.29 
 
 
315 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  32.05 
 
 
328 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  27.99 
 
 
320 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  30.12 
 
 
438 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  33.56 
 
 
307 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  33.56 
 
 
307 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  33.56 
 
 
307 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  32.53 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  33.56 
 
 
307 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  26.82 
 
 
320 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.78 
 
 
348 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  33.56 
 
 
307 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  32.88 
 
 
307 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  26.45 
 
 
317 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  32.19 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  28.8 
 
 
419 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  27.43 
 
 
311 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  31.51 
 
 
307 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  27.88 
 
 
307 aa  143  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.08 
 
 
444 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  31.16 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  30.45 
 
 
307 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  27.15 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  26.3 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  26.61 
 
 
444 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  30 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.46 
 
 
338 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  29.17 
 
 
402 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  27.22 
 
 
381 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  29.77 
 
 
415 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 
433 aa  125  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  25.22 
 
 
429 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.75 
 
 
326 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  31.6 
 
 
337 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  33.44 
 
 
344 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  28.01 
 
 
420 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  28.25 
 
 
350 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  31.65 
 
 
315 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.65 
 
 
402 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  23.66 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.68 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  30.05 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.34 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  30.08 
 
 
412 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  34.31 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  39.64 
 
 
602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  30.18 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  26.63 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  28.53 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  33.87 
 
 
400 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  27.46 
 
 
390 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  27.97 
 
 
388 aa  109  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  29.74 
 
 
345 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  31.56 
 
 
359 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  26.04 
 
 
323 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  27.25 
 
 
307 aa  106  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  24.68 
 
 
357 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  30 
 
 
400 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  25.43 
 
 
412 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  26.74 
 
 
397 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  27.89 
 
 
390 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  28.46 
 
 
327 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6999  peptidase M19 renal dipeptidase  28.14 
 
 
356 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  27.72 
 
 
362 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4630  peptidase M19 renal dipeptidase  30.94 
 
 
350 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  30.6 
 
 
223 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  24.56 
 
 
323 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  28.88 
 
 
356 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  24.56 
 
 
323 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  26.29 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  29.21 
 
 
345 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>