More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3269 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1991  molybdopterin binding domain-containing protein  70.22 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  48.31 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  41.92 
 
 		 274 aa  225  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000053068  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  41.55 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  36.47 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  39.46 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  40.54 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  41.01 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  37.9 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  33.64 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  37.94 
 
 		 415 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  31.11 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  37.56 
 
 		 408 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  36.6 
 
 		 408 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  30.33 
 
 		 413 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  37.98 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  35.9 
 
 		 408 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  32.8 
 
 		 391 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 395 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  32.72 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  31.87 
 
 		 420 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  32 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  31.17 
 
 		 401 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  28.28 
 
 		 415 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  31.37 
 
 		 425 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  31.23 
 
 		 411 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  39.89 
 
 		 413 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  31.09 
 
 		 416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  32.19 
 
 		 419 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  32.93 
 
 		 423 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  30.74 
 
 		 417 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.43 
 
 		 415 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  32.12 
 
 		 427 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  28.4 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  32 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  39.43 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  39.02 
 
 		 408 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  36.41 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  38.58 
 
 		 423 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  27.41 
 
 		 406 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  36.16 
 
 		 415 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  35 
 
 		 418 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  31.67 
 
 		 410 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.34 
 
 		 424 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.88 
 
 		 429 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  38.95 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  35.56 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.47 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  31.79 
 
 		 403 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  34.97 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.9 
 
 		 424 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  34.97 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.72 
 
 		 401 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  28.57 
 
 		 415 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  31.36 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  34.97 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  34.97 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  35.24 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  34.97 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  31.16 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  33.88 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  35.23 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  28.57 
 
 		 372 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  28.99 
 
 		 416 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  33.88 
 
 		 400 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  34.68 
 
 		 408 aa  99.4  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  33.88 
 
 		 400 aa  99  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  33.88 
 
 		 400 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  33.88 
 
 		 400 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  33.88 
 
 		 400 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  33.88 
 
 		 400 aa  99  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  30.8 
 
 		 421 aa  99  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0887  molybdopterin binding domain protein  37.21 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  31.71 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 		 400 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 		 416 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  31.67 
 
 		 437 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  28.34 
 
 		 415 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  31.86 
 
 		 413 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  32.71 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  35.91 
 
 		 397 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  37.08 
 
 		 413 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  33.02 
 
 		 424 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  35.67 
 
 		 400 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 		 397 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 		 397 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  35.39 
 
 		 414 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  32.78 
 
 		 414 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  35.39 
 
 		 411 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  33.15 
 
 		 438 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  31.47 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  29.41 
 
 		 418 aa  95.5  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  27.1 
 
 		 412 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  30.11 
 
 		 412 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>