16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3226 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  76.15 
 
 		 117 aa  177  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  50.93 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  46.36 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  52.88 
 
 		 206 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  42.72 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  29.07 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  27.52 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  30.39 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  35.29 
 
 		 53 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>