45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3208 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  100 
 
 		 689 aa  1378    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  83.72 
 
 		 697 aa  1154    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  34.71 
 
 		 496 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.28 
 
 		 943 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 1958 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1238 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  25.08 
 
 		 806 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  27.03 
 
 		 699 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  25.53 
 
 		 823 aa  106  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  26.87 
 
 		 835 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  28.53 
 
 		 534 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  30.38 
 
 		 544 aa  94.7  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  24.85 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  28.39 
 
 		 525 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  29.61 
 
 		 1203 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1313 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  28.27 
 
 		 569 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1063 aa  72  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1298 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  29.19 
 
 		 689 aa  65.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  31.39 
 
 		 1914 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  23.22 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2419  hypothetical protein  24.59 
 
 		 431 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.783894  normal  0.656965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1714 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  27.58 
 
 		 684 aa  62  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.59 
 
 		 1104 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  28.1 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  28.1 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.96 
 
 		 1611 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1101 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1285 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  28.95 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1986  hypothetical protein  36.97 
 
 		 682 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 1450 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  28.11 
 
 		 534 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1725  FHA domain containing protein  28.68 
 
 		 781 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.184636  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  33.6 
 
 		 848 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  27.98 
 
 		 690 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1921 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  31.03 
 
 		 383 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2099  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 429 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6006  hypothetical protein  27.27 
 
 		 610 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.52 
 
 		 960 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>