More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3207 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  79.43 
 
 
1152 aa  1773    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
1157 aa  2292    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.21 
 
 
1711 aa  323  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 
1760 aa  294  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.23 
 
 
1598 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.9 
 
 
1240 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  38.73 
 
 
1699 aa  238  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.79 
 
 
1236 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  24.17 
 
 
1026 aa  234  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
1078 aa  230  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.7 
 
 
1481 aa  224  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
972 aa  221  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.85 
 
 
1190 aa  220  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  33.1 
 
 
1553 aa  218  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
902 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  35.27 
 
 
1265 aa  217  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.96 
 
 
1357 aa  217  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.01 
 
 
1686 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.58 
 
 
1344 aa  212  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.16 
 
 
1623 aa  211  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
973 aa  211  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  36.02 
 
 
969 aa  210  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  36.02 
 
 
969 aa  210  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.55 
 
 
1599 aa  207  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.37 
 
 
1510 aa  206  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  36.3 
 
 
885 aa  202  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  34.23 
 
 
1733 aa  201  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.12 
 
 
1626 aa  201  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 
897 aa  198  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  35.7 
 
 
1013 aa  197  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.91 
 
 
1547 aa  196  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 
1353 aa  195  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  31.37 
 
 
1308 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  33.83 
 
 
1657 aa  192  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.76 
 
 
1607 aa  192  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 
1334 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.16 
 
 
1583 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.55 
 
 
1609 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.28 
 
 
1398 aa  188  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  31.02 
 
 
1073 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.2 
 
 
1617 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 
1032 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.18 
 
 
1823 aa  181  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 
965 aa  181  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  31.56 
 
 
901 aa  178  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 
1046 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 
1014 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  32.35 
 
 
1230 aa  157  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  33.84 
 
 
1005 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.37 
 
 
1399 aa  155  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  27.57 
 
 
1432 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 
1020 aa  149  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.5 
 
 
1267 aa  148  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  28.76 
 
 
1124 aa  147  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  31.52 
 
 
994 aa  144  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.81 
 
 
924 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  34.14 
 
 
1194 aa  142  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
1314 aa  141  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  29.05 
 
 
1392 aa  138  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.94 
 
 
1217 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
947 aa  137  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  29.75 
 
 
1075 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  29.75 
 
 
1063 aa  135  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  29.75 
 
 
1080 aa  135  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  29.29 
 
 
1075 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.1 
 
 
1363 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
1557 aa  129  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  32.7 
 
 
1401 aa  128  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  28.89 
 
 
1092 aa  127  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 
1085 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  30.23 
 
 
1491 aa  125  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
1831 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.23 
 
 
1652 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.74 
 
 
505 aa  123  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  28.74 
 
 
1067 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  28.51 
 
 
1089 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.03 
 
 
1364 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  29.2 
 
 
1089 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.41 
 
 
1262 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.36 
 
 
1190 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  28.05 
 
 
1075 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.95 
 
 
1163 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  28.94 
 
 
1102 aa  119  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.41 
 
 
1188 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 
1766 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.48 
 
 
1552 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.07 
 
 
919 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.04 
 
 
1443 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.39 
 
 
1229 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.65 
 
 
740 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 
1304 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.86 
 
 
1856 aa  115  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.14 
 
 
1714 aa  115  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.5 
 
 
1684 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.96 
 
 
1193 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.63 
 
 
1868 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.82 
 
 
1196 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  27.81 
 
 
1301 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 
1161 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.28 
 
 
1161 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>