More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3202 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  100 
 
 		 182 aa  362  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  70.88 
 
 		 182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  33.91 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  35.09 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  32.14 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  31.55 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  30.23 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  36.36 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  28.88 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  31.43 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.58 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  40.56 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.66 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  30.06 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  40.56 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  31.03 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  28.99 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  30.34 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.94 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  36.15 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  37.88 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  37.37 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.89 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  32.79 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  27.69 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  40 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.21 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  28 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  31.25 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25.35 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  26.47 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  27.94 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.21 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.31 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.21 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.21 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.21 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  27.1 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.17 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  26.71 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.74 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.21 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  28.45 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.21 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.21 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  26.96 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.52 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  30.08 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.21 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  28.45 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.27 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  34.25 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  27.46 
 
 		 365 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  28.45 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  29.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  24.63 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.37 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.21 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  25.36 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  24.63 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  31.03 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  28.68 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  23.84 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  25.37 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  28.99 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  31.65 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.26 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  29.73 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  34.69 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.26 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.26 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  24.37 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  26.95 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  29.51 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  30.97 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  26.11 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  27.05 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  25.31 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  33.62 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1832  CheW protein  30.3 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0194575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  23.53 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.53 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  24.24 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.22 
 
 		 907 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  29.29 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  24.26 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  34.69 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  23.53 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  23.53 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  26.76 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  28.47 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  27.64 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  28.47 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  31.11 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  26.14 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  28.7 
 
 		 779 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  26.67 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  28.87 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>