More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3200 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 781 aa  1553    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  73.6 
 
 		 783 aa  1141    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 772 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 777 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  31.59 
 
 		 764 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 777 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  33.85 
 
 		 764 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 756 aa  343  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 705 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 705 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  29.89 
 
 		 798 aa  336  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 741 aa  330  7e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  38.78 
 
 		 878 aa  329  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 742 aa  328  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.13 
 
 		 734 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 762 aa  321  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 740 aa  320  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  27.45 
 
 		 769 aa  312  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 865 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 865 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  27.06 
 
 		 769 aa  307  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  26.96 
 
 		 769 aa  308  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 686 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  32.38 
 
 		 752 aa  307  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  27.75 
 
 		 783 aa  303  8.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 830 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.14 
 
 		 1992 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 758 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  30.45 
 
 		 1987 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 760 aa  296  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.46 
 
 		 763 aa  293  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  31.06 
 
 		 768 aa  293  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 934 aa  292  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.85 
 
 		 764 aa  292  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 679 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 706 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 679 aa  290  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 706 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.62 
 
 		 803 aa  281  5e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 766 aa  280  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 769 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  30.2 
 
 		 769 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  30.2 
 
 		 769 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.52 
 
 		 764 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  31.85 
 
 		 785 aa  278  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.11 
 
 		 789 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  31.93 
 
 		 770 aa  277  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 769 aa  277  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 896 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 896 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 755 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 2423 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 804 aa  273  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  32.24 
 
 		 2458 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  31.85 
 
 		 774 aa  273  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 2539 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.67 
 
 		 1971 aa  272  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 2212 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2297  CheA signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 799 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 777 aa  271  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 1832 aa  271  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  32.08 
 
 		 2476 aa  271  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  30.72 
 
 		 770 aa  270  5e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 1758 aa  269  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 767 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.31 
 
 		 2336 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.68 
 
 		 2301 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  34.1 
 
 		 832 aa  267  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 808 aa  267  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 801 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.53 
 
 		 769 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.72 
 
 		 1866 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 750 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  27.59 
 
 		 2301 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 		 864 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 		 864 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.45 
 
 		 864 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.45 
 
 		 864 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.45 
 
 		 864 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.45 
 
 		 864 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  34.32 
 
 		 839 aa  263  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 1725 aa  262  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.31 
 
 		 2284 aa  262  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 2012 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  32.08 
 
 		 748 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 756 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 756 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 753 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  33.72 
 
 		 1079 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 769 aa  260  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 1725 aa  260  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.07 
 
 		 793 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 748 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 2009 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 1974 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 1646 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  29.72 
 
 		 2048 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 1646 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 928 aa  256  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>