More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3193 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  100 
 
 
333 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  90.06 
 
 
333 aa  627  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  68.37 
 
 
332 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  58.91 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  49.53 
 
 
343 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
345 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  50.93 
 
 
340 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
342 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  45.75 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  47.32 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  48.29 
 
 
343 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  47.08 
 
 
344 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  47.68 
 
 
341 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  46.75 
 
 
335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  44.48 
 
 
349 aa  268  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  45.03 
 
 
349 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.06 
 
 
341 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
339 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  47.95 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  45.85 
 
 
344 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  44.97 
 
 
368 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
325 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  48.3 
 
 
344 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
329 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  44.05 
 
 
348 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  45.31 
 
 
325 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
336 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  47.95 
 
 
342 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
339 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  45.02 
 
 
326 aa  255  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  45.71 
 
 
345 aa  255  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  44.55 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  42.55 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
339 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
352 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
352 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
339 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
339 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
325 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
335 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  42.77 
 
 
327 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  41.39 
 
 
335 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  43.51 
 
 
316 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  43.44 
 
 
337 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  43.09 
 
 
326 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
323 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  44.3 
 
 
327 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
339 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
326 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  46.46 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
328 aa  245  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
326 aa  245  6.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  44.05 
 
 
324 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  43.45 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  41.54 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  40.48 
 
 
335 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4538  aldo/keto reductase  43.47 
 
 
323 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.835863  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
337 aa  242  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
326 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
326 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
353 aa  242  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
324 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  41.56 
 
 
350 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
326 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
328 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.58 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  40.75 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  41.99 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
328 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  43.41 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  41.08 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  41.34 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
345 aa  239  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  38.71 
 
 
323 aa  238  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  40.44 
 
 
335 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
327 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
323 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  41.56 
 
 
326 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
342 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  41.56 
 
 
332 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
346 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
344 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  41.18 
 
 
334 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
358 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  42.31 
 
 
343 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  41.94 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  44.16 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1837  aldo/keto reductase  44.28 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
326 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
330 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  42.17 
 
 
313 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>