More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3151 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
533 aa  1052  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  88.74 
 
 
533 aa  910  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  36.99 
 
 
514 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 
514 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  34.91 
 
 
513 aa  199  1e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4231  hypothetical protein  32.36 
 
 
514 aa  174  3e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 
381 aa  153  6e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.31 
 
 
521 aa  140  5e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 
621 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  34.4 
 
 
477 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 
586 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 
477 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 
587 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 
509 aa  94  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 
608 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.95 
 
 
501 aa  85.9  2e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.78 
 
 
502 aa  84.7  4e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 
641 aa  81.3  5e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 
421 aa  80.9  5e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.06 
 
 
586 aa  79.7  1e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 
462 aa  79.3  2e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.55017e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 
430 aa  73.9  7e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.42 
 
 
399 aa  73.6  9e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  7.56014e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 
541 aa  72.8  1e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 
621 aa  73.2  1e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  28.87 
 
 
431 aa  72.8  2e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  26.91 
 
 
394 aa  72.4  2e-11  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 
541 aa  67.8  4e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 
481 aa  67.8  5e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 
311 aa  67.4  6e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.87759e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 
409 aa  67  7e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.85815e-06  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.73 
 
 
435 aa  67.4  7e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  29.85 
 
 
411 aa  66.2  1e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 
416 aa  65.9  2e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.24755e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  31.67 
 
 
384 aa  65.9  2e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.54 
 
 
549 aa  65.5  3e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 
457 aa  65.1  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  28.69 
 
 
394 aa  64.7  4e-09  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  26.5 
 
 
424 aa  64.7  4e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.72 
 
 
476 aa  64.3  5e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 
367 aa  64.3  5e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 
374 aa  63.9  6e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.26 
 
 
390 aa  63.9  6e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 
374 aa  63.9  6e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  30.54 
 
 
397 aa  63.9  7e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 
322 aa  63.5  8e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  31.07 
 
 
225 aa  63.5  9e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2879  hypothetical protein  26.07 
 
 
355 aa  62.8  2e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 
432 aa  62.4  2e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 
598 aa  62.4  2e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  29.65 
 
 
417 aa  62.4  2e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  26.28 
 
 
504 aa  62  3e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 
416 aa  61.6  4e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  6.42362e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 
450 aa  61.2  4e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 
416 aa  61.2  4e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.87508e-07  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  28.44 
 
 
405 aa  60.8  5e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 
389 aa  60.8  6e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 
416 aa  60.8  6e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.21535e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 
391 aa  60.8  6e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 
392 aa  60.5  7e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  3.23168e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  28.69 
 
 
396 aa  60.5  7e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 
410 aa  60.5  7e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.9827e-08  hitchhiker  2.36896e-09 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  28.09 
 
 
401 aa  60.1  9e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 
335 aa  59.7  1e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  26.58 
 
 
396 aa  60.1  1e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  21.95 
 
 
417 aa  60.1  1e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.09 
 
 
400 aa  59.7  1e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  24.04 
 
 
377 aa  58.9  2e-07  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  31.58 
 
 
396 aa  59.3  2e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  22.4 
 
 
607 aa  59.3  2e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  31.6 
 
 
389 aa  58.9  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.41 
 
 
413 aa  58.2  3e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.15 
 
 
408 aa  58.2  4e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  33.66 
 
 
598 aa  58.2  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 
335 aa  58.2  4e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  31.19 
 
 
389 aa  58.2  4e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 
355 aa  57.8  5e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  31.07 
 
 
491 aa  57.4  6e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.16 
 
 
400 aa  57.4  6e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  31.49 
 
 
490 aa  57.4  6e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 
397 aa  57.4  7e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  28.87 
 
 
397 aa  57.4  7e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 
397 aa  57.4  7e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 
385 aa  57.4  7e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 
488 aa  57  8e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 
488 aa  57  8e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 
488 aa  57  8e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.38 
 
 
377 aa  57  9e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
381 aa  57  9e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.04 
 
 
421 aa  56.2  1e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 
321 aa  56.2  1e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 
406 aa  56.2  1e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1576  hypothetical protein  22.57 
 
 
538 aa  56.2  1e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  4.69738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  27.85 
 
 
503 aa  56.2  1e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.03 
 
 
397 aa  56.6  1e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  2.97953e-07 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  34.44 
 
 
509 aa  56.6  1e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  31.75 
 
 
536 aa  55.8  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 
366 aa  55.5  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  22.9 
 
 
402 aa  55.8  2e-06  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.8 
 
 
371 aa  55.8  2e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>