266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3137 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 127 aa  246  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  74.6 
 
 		 126 aa  170  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  55.28 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  52.38 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  45.31 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 164 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  48.36 
 
 		 132 aa  110  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  47.66 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  51.26 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  44.88 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  46.09 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  47.66 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  48.39 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  42.75 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  47.97 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  43.85 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  52.63 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  41.91 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  44.6 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  45.24 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  43.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  43.41 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  43.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  44.88 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  44.6 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  44.88 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  51.2 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  43.17 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  42.64 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  44.8 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  48.78 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  39.55 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  47.97 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  47.22 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  41.98 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  43.31 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  40.56 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  44.88 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  43.15 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  41.26 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  39.71 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  44.9 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  46.56 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  51.49 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  43.07 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  41.55 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  36.23 
 
 		 201 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 176 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  40.29 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  38.19 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  40.15 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  38.85 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  39.57 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  40.62 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  46.04 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  40.91 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  40.41 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  41.03 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  42.06 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  39.68 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  42.14 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  41.03 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  37.59 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  38.35 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  39.73 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  45.32 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  45.32 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  36.84 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  35.77 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  35.77 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  38.85 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  39.1 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  37.14 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  40.58 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  36.84 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  36.84 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>