More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3131 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  100 
 
 		 367 aa  732    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  88.28 
 
 		 367 aa  597  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  50.4 
 
 		 374 aa  359  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4040  cell cycle protein  45.58 
 
 		 380 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  43.41 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.86 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.36 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.54 
 
 		 379 aa  235  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  39.53 
 
 		 412 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  37.02 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  36.74 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  36.62 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.77 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  37.7 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  39.34 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  39.34 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  39.34 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  38.02 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.16 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.63 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  38.5 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  36.84 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  39.02 
 
 		 370 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  38.33 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.67 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.15 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  38.36 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  37.13 
 
 		 373 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  40.53 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.81 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.81 
 
 		 366 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1526  cell cycle protein  41.67 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  38.27 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  35.85 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  38.56 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.89 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  39.32 
 
 		 380 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.1 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  37.25 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  37.25 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  37.69 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  37.25 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  37.25 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  37.25 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  35.09 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  37.8 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  37.54 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  39.47 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  37.64 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  37.54 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  37.54 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  37.54 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  37.54 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  35.85 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  37.54 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  37.54 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  37.91 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  39.88 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  32.24 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  37.69 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  38.8 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  39.1 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  38.54 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  38.49 
 
 		 380 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  35.33 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  38.15 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  35.33 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  36.66 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  36.66 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  38.18 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  35.22 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  36.96 
 
 		 371 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  34.95 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  33.82 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>