More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3085 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
348 aa  692    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  89.12 
 
 
342 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.94 
 
 
339 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.95 
 
 
336 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.44 
 
 
335 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  45.38 
 
 
340 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.2 
 
 
299 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.16 
 
 
299 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.63 
 
 
313 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.81 
 
 
296 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.69 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.91 
 
 
295 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.05 
 
 
382 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.05 
 
 
382 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.57 
 
 
366 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.65 
 
 
282 aa  185  9e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  45.61 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  43.56 
 
 
297 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  46.19 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.67 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.27 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.67 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  38.05 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.33 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.71 
 
 
383 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.44 
 
 
290 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.65 
 
 
295 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  42.15 
 
 
270 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  45.23 
 
 
273 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  38.24 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.16 
 
 
335 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.74 
 
 
282 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  47.46 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  39.51 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.59 
 
 
319 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.37 
 
 
593 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.37 
 
 
593 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.92 
 
 
617 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.76 
 
 
656 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.64 
 
 
298 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.4 
 
 
297 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.5 
 
 
269 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.66 
 
 
290 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.58 
 
 
371 aa  160  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.16 
 
 
324 aa  159  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  42 
 
 
269 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45 
 
 
296 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  42.5 
 
 
269 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  41.67 
 
 
269 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  40.17 
 
 
623 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.44 
 
 
326 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.37 
 
 
593 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.92 
 
 
329 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.72 
 
 
598 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.72 
 
 
598 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  34.98 
 
 
303 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.25 
 
 
269 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.91 
 
 
272 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  45.25 
 
 
269 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.91 
 
 
272 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.88 
 
 
605 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.94 
 
 
637 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.56 
 
 
566 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  37.72 
 
 
269 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  41.04 
 
 
616 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  43.88 
 
 
273 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  41.15 
 
 
616 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.25 
 
 
323 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  36.5 
 
 
608 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.1 
 
 
321 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.08 
 
 
595 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.64 
 
 
615 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  42.22 
 
 
270 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.64 
 
 
615 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.64 
 
 
615 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.82 
 
 
270 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.07 
 
 
617 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  41.05 
 
 
612 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.34 
 
 
311 aa  149  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.77 
 
 
613 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.31 
 
 
587 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.22 
 
 
613 aa  149  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.6 
 
 
563 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.51 
 
 
611 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  39.15 
 
 
617 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.19 
 
 
615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.08 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  39.73 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.84 
 
 
649 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.29 
 
 
614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  37.34 
 
 
569 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.39 
 
 
274 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.41 
 
 
293 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  40.1 
 
 
616 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  38.67 
 
 
610 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.26 
 
 
595 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.39 
 
 
614 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.84 
 
 
614 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.67 
 
 
614 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  43.43 
 
 
273 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>