More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3072 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
214 aa  428  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  94.86 
 
 
214 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  49.3 
 
 
214 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  47.42 
 
 
214 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  46.77 
 
 
221 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  47.74 
 
 
221 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  46.48 
 
 
221 aa  174  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  44.39 
 
 
264 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  44.44 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  42.86 
 
 
236 aa  173  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  43.94 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  44 
 
 
222 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  39.72 
 
 
221 aa  168  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  43.35 
 
 
227 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  45.27 
 
 
219 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  44.33 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  49 
 
 
220 aa  165  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  43.3 
 
 
216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  45.27 
 
 
221 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  44.33 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  44.85 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  43.72 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  42.79 
 
 
221 aa  161  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  46.23 
 
 
222 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  40 
 
 
206 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  43.78 
 
 
221 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  43.43 
 
 
217 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  43.43 
 
 
217 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  43.43 
 
 
217 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  40 
 
 
219 aa  158  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  41.23 
 
 
224 aa  158  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  44.33 
 
 
216 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  41.58 
 
 
220 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  40.89 
 
 
223 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  39.8 
 
 
220 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  43.93 
 
 
243 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  40.39 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  52.59 
 
 
137 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  40.91 
 
 
233 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  40.89 
 
 
224 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  38.89 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  34 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  51.2 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  42.54 
 
 
134 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  41.79 
 
 
134 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  36.82 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  46.15 
 
 
138 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  41.04 
 
 
134 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  41.04 
 
 
134 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  43.61 
 
 
143 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 
143 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  32.5 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  34.59 
 
 
141 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 
221 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  30.15 
 
 
221 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  33.02 
 
 
459 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.97 
 
 
626 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.15 
 
 
221 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  37.78 
 
 
142 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  34.27 
 
 
153 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 
620 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  23.08 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  32.06 
 
 
458 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 
458 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  30.26 
 
 
458 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  31.6 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  28 
 
 
222 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  30.4 
 
 
457 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  29.72 
 
 
459 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 
458 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 
458 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  27.72 
 
 
225 aa  89  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  30.33 
 
 
457 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.35 
 
 
220 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  30.69 
 
 
220 aa  89  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  30.2 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  31.02 
 
 
458 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
458 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
458 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  33.01 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
458 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 
457 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  31.02 
 
 
458 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  30.56 
 
 
458 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 
457 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.05 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.01 
 
 
630 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  31.28 
 
 
457 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  31.16 
 
 
457 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
458 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
458 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
458 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
458 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
458 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 
458 aa  85.5  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.69 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  30.56 
 
 
458 aa  85.5  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>