165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2990 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  57.27 
 
 
685 aa  764    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  46.95 
 
 
686 aa  669    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  86.47 
 
 
700 aa  1232    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  100 
 
 
696 aa  1417    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  52.98 
 
 
681 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  55.52 
 
 
693 aa  736    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  46.69 
 
 
690 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  45.02 
 
 
680 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  46.14 
 
 
684 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  48.77 
 
 
666 aa  605  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  46.58 
 
 
752 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  45.13 
 
 
699 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  50.72 
 
 
662 aa  596  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  42.88 
 
 
686 aa  591  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  48.85 
 
 
678 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  42.94 
 
 
675 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  41.23 
 
 
711 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  45.56 
 
 
699 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  44.32 
 
 
673 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  47.12 
 
 
725 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  47.31 
 
 
665 aa  569  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  48.6 
 
 
682 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  47.05 
 
 
665 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  45.11 
 
 
711 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  46.9 
 
 
667 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  49.28 
 
 
665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  43.38 
 
 
680 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  44.06 
 
 
751 aa  556  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  47.22 
 
 
718 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  47.02 
 
 
658 aa  555  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  40.29 
 
 
686 aa  554  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  39.45 
 
 
703 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  47.73 
 
 
677 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  46.32 
 
 
672 aa  548  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  42.47 
 
 
712 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  43.86 
 
 
721 aa  548  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  45.41 
 
 
700 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  42.57 
 
 
720 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  46.17 
 
 
710 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  45.44 
 
 
673 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  41.15 
 
 
737 aa  535  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  43.38 
 
 
669 aa  528  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  46.12 
 
 
652 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1103  protein of unknown function DUF255  48 
 
 
687 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.491204  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  46.85 
 
 
718 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  44.83 
 
 
706 aa  521  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  47.59 
 
 
682 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  41.31 
 
 
756 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  39.03 
 
 
681 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  44.41 
 
 
699 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  46.56 
 
 
718 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  43.88 
 
 
750 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  43.53 
 
 
669 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  38.82 
 
 
691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  41.82 
 
 
706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  43.48 
 
 
705 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  40.52 
 
 
723 aa  512  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  42.19 
 
 
715 aa  513  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  42.47 
 
 
707 aa  512  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  43.31 
 
 
746 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  43.11 
 
 
660 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  43.55 
 
 
700 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  44.17 
 
 
699 aa  510  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  44.57 
 
 
673 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  41.75 
 
 
700 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  42.98 
 
 
715 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  41.6 
 
 
720 aa  507  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  44.86 
 
 
656 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  40.18 
 
 
670 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  43.38 
 
 
694 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  44.4 
 
 
697 aa  502  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  37 
 
 
687 aa  502  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  42.84 
 
 
681 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  39.8 
 
 
671 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  45.59 
 
 
657 aa  495  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  44.59 
 
 
679 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  41.65 
 
 
722 aa  494  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  42.73 
 
 
714 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  43.93 
 
 
677 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  41.09 
 
 
733 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  44.02 
 
 
676 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  44.59 
 
 
664 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  44.59 
 
 
664 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  44.38 
 
 
664 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  43.2 
 
 
673 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  43.64 
 
 
641 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  42.14 
 
 
682 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  42.3 
 
 
676 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3705  protein of unknown function DUF255  46.26 
 
 
703 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164339  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  41.48 
 
 
676 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  34.83 
 
 
681 aa  465  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  44.01 
 
 
667 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  40.32 
 
 
744 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  44.25 
 
 
673 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  39.12 
 
 
717 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  40.14 
 
 
687 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  42.06 
 
 
696 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  42.19 
 
 
669 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  36.66 
 
 
705 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  37.5 
 
 
700 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>